Chimiothèque Nationale

Chimiothèque Nationale

Autres noms	GIS Chimiothèque Nationale
URL	https://chembiofrance.cn.cnrs.fr/fr/composante/chimiotheque
Tutelles	CNRS
Localisation	Montpellier

Service

Type de service	Entrepôt de données
	Caractéristiques de l'entrepôt Type d’entrepôt Disciplinaire, National Restrictions au dépôt Réservé à une institution/ un projet/ un instrument, Soumis à étude et validation Hébergement des données France Identifiant pérenne ✕ Identifiants fournis Identifiants utilisés Formats de fichiers acceptés Schéma de métadonnées Licence des jeux de données Conditions d'accès aux données Restreint Modération / Curation Volumétrie maximale définie Politique de conservation des données Interopérabilité machine Versioning
Statut	En production
URL	https://chembiofrance.cn.cnrs.fr/fr/composante/chimiotheque
Contact	contact@chembiofrance.org
Structure d'appartenance	ChemBioFrance

Cycle de vie des données

Ce service intervient au cours des stades du cycle de vie suivants :

Collecte

Documentation

Conservation

Réutilisation

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La Chimiothèque Nationale (CN) regroupe les collections de produits de synthèse, de composés naturels et d’extraits naturels existants dans les laboratoires publics français (70.000 composés et 15.000 extraits naturels, pour la plupart originaux et peu testés). Conditionnés sous une forme standardisée compatible avec le criblage à haut ou moyen débit, ces composés peuvent être sollicités dans le cadre de collaborations scientifiques, au travers des procédures simples, rapides, peu onéreuses et protégées juridiquement. La Chimiothèque Nationale propose également des partenaires compétents pour les développements hit-to-lead.

Depuis janvier 2007, la CN a pris la forme juridique d’un Groupement d’Intérêt Scientifique (GIS) entre le CNRS et 41 établissements d’enseignement supérieur et de recherche. Le GIS Chimiothèque Nationale fédère 48 laboratoires de chimie. Chaque laboratoire reste responsable de ses molécules et substances, accède aux informations concernant tous les produits présents dans la Chimiothèque Nationale.

La CN a pour objectifs :

• La sauvegarde et la conservation du patrimoine chimique existant dans les laboratoires académiques nationaux
• la valorisation scientifique et industrielle des produits vers des applications pharmaceutiques, cosmétiques, phytosanitaires dans le cadre de collaborations scientifiques entre chimistes et biologistes.

Les missions de la CN sont:

• Fédérer les laboratoires de recherche français souhaitant promouvoir la constitution et la valorisation scientifique et industrielle de collections de produits chimiques de synthèse et de substances naturelles, dans un format compatible avec les robots de criblage biologique;
• Constituer un répertoire global de ces collections, plus complet et divers que chacune des collections considérées séparément ;
• Promouvoir la mise à disposition de la Chimiothèque Nationale et des chimiothèques « essentielles» (CNE), auprès des chercheurs chimistes et biologistes, académiques et industriels en vue de criblages;
• Sensibiliser la communauté scientifique à la valorisation des produits actifs découverts en outils de recherche et en candidats médicaments, notamment par des actions de formation;

La CN peut apporter une aide technique, financière et administrative à chaque laboratoire de chimie pour l’organisation d’une échantillothèque et la création d’une banque de données informatique.

La CN fait partie de l’infrastructure ChemBioFrance labellisée infrastructure nationale en 2018.

Domaines scientifiques :Sciences & Technologies, Vie & Santé

PE4 Chimie physique et analytique; PE5 Chimie de synthèse et matériaux LS1 Molécules de la vie : Mécanismes biologiques, structures et fonctions Thématique et/ou mots clés :

• Chimiothèque académique
• Collections de produits de synthèse
• Collections de composés naturels
• Collections d’extraits naturels
• Chimio-informatique
• Logiciel MDL Isis/Base
• Format SDF
• Standard database format
• Criblage biologique
• Criblage haut débit
• Relation structure activité
• Visualisation structures chimiques

Type de données :Bases de données chimiques, Base de données structurales

Communauté d'utilisateurs : Chimistes des laboratoires publics qui sont membres du GIS Chimiothèque Nationale, Biologistes des laboratoires publics et privés Usagers et bénéficiaires :Chercheurs

Conditions d'usage : Fichier des structures de la Chimiothèque Nationale et de la CNE (chimiothèque essentielle) téléchargeable pour les utilisateurs enregistrés : https://chembiofrance.org/acces-aux-bases-de-donnees-utilisateurs-enregistres. Pour adhérer à ChemBioFrance prendre contact avec le responsable du pilier Chimiothèque Nationale. Pour les prestations : formulaire de demande projet sur le site ChemBioFrance

Conditions tarifaires : Gratuit pour l'accès aux bases de données (nécessite un enregistrement préalable). Payant pour l'acquisition des produits issus des collections de la Chimiothèque Nationale (participation aux frais de conditionnement, de gestion de dossier et d’expédition)

Certification/Label :

Conditions générales d'utilisation : https://chembiofrance.cn.cnrs.fr/fr/static/dl/regles generales de fonctionnement CN mars2023-fr.pdf

Offre de services de Chimiothèque Nationale

• USCBF-CN (Accompagnement)

Services proposés par la structure d'appartenance

Structure	Services proposés
ChemBioFrance	Chimiothèque Nationale USCBF-CN ADME-Tox Criblage Chémoinformatique

Groupement d'intérêt scientifique

Centre National de la Recherche Scientifique

code unique assigné à un objet de façon permanente (DOI, Handle…).

Ensemble structuré d’informations décrivant, expliquant et localisant une ressource physique ou numérique

autorisation par laquelle l'auteur d’une œuvre de l’esprit concède certains des droits que lui offre le droit d'auteur quant à l'utilisation, à la modification, à la rediffusion et à la réutilisation de l'œuvre.

la curation de données consiste à trier, organiser et mettre en forme un ensemble de données, de manière à le rendre exploitable.

capable de communiquer et d’opérer avec d’autres systèmes d’information.