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« AuBI » : différence entre les versions
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|ContactMel=support.dsi@uca.fr , aubi@uca.fr | |ContactMel=support.dsi@uca.fr , aubi@uca.fr | ||
|Localisation=Clermont-Ferrand | |Localisation=Clermont-Ferrand | ||
|StructureAppartenance=IFB | |StructureAppartenance=IFB, Université Clermont Auvergne | ||
|Tutelle=Université Clermont Auvergne, CNRS, INRAE | |Tutelle=Université Clermont Auvergne, CNRS, INRAE | ||
|PhaseCycleVie=Analyse, Documentation, Conservation | |IdentifiantAlternatif=https://doi.org/10.18145/AuBI; DOI, https://aurehal.archives-ouvertes.fr/structure/read/id/1076817; HAL | ||
|PhaseCycleVie=Analyse, Documentation, Stockage, Conservation | |||
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{{Coordonnées GPS | {{Coordonnées GPS | ||
| Ligne 20 : | Ligne 21 : | ||
Le Mésocentre Clermont Auvergne fournit un accès à des banques de données biologiques publiques. Leurs mises à jours sont gérées par [https://biomaj.genouest.org/ BioMAJ]. Les données brutes proviennent de sites distants (NCBI, flybase, ensembl, ...) et sont indexées automatiquement en local pour être utilisées ensuite par les différents outils sur le cluster de calcul HPC2 ou via le serveur web Galaxy. | Le Mésocentre Clermont Auvergne fournit un accès à des banques de données biologiques publiques. Leurs mises à jours sont gérées par [https://biomaj.genouest.org/ BioMAJ]. Les données brutes proviennent de sites distants (NCBI, flybase, ensembl, ...) et sont indexées automatiquement en local pour être utilisées ensuite par les différents outils sur le cluster de calcul HPC2 ou via le serveur web Galaxy. | ||
La liste des banques de données disponibles et les informations afférentes sont accessibles grâce à l'interface [https://biodatabanks.mesocentre.uca.fr/app/#/bank]. | La liste des banques de données disponibles et les informations afférentes sont accessibles grâce à l'interface [https://biodatabanks.mesocentre.uca.fr/app/#/bank/ Biomaj Watcher]. | ||
Deux services web sont proposés au sein d'AuBI : | |||
Deux services web sont proposés | |||
* '''Galaxy''', pour y conduire des analyses de transcriptomique, génomique, métagénomique | * '''Galaxy''', pour y conduire des analyses de transcriptomique, génomique, métagénomique | ||
* '''OMERO''', pour le stockage d'images et des métadonnées associées | * '''[[OMERO]]''', pour le stockage d'images et des métadonnées associées | ||
|Discipline=Vie & Santé | |Discipline=Vie & Santé | ||
|SousDisciplineVie&Sante=LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes | |SousDisciplineVie&Sante=LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes | ||
|Thematique=Plateforme de bioinformatique, Biologie fondamentale, Microbiologie, Agronomie, Environnement, Santé, Epidémiologie | |Thematique=Plateforme de bioinformatique, Biologie fondamentale, Microbiologie, Agronomie, Environnement, Santé, Epidémiologie | ||
|ModeleEconomique=Gratuit pour | |Communaute=Unités de recherche de l'Université Clermont Auvergne | ||
|Beneficiaire=Chercheurs, Enseignants-Chercheurs, Doctorants | |||
|ModeleEconomique=Gratuit pour les usagers UCA & associés | |||
|Relation=France Génomique, Mésocentre Clermont Auvergne, CNRS Biologie, CNRS Écologie & Environnement | |Relation=France Génomique, Mésocentre Clermont Auvergne, CNRS Biologie, CNRS Écologie & Environnement | ||
}} | }} | ||
[[Catégorie:Catalogue CNRS | [[Catégorie:Catalogue CNRS Biologie]] | ||