« MatrixDB » : différence entre les versions
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{{Infobox Service | {{Infobox Service | ||
|Logo= | |Logo=Matrixdb logo.png | ||
|NomService=MatrixDB | |NomService=MatrixDB | ||
|TypeService=Entrepôt de données | |TypeService=Entrepôt de données | ||
|TypeEntrepot=Disciplinaire | |||
|TypeRestriction=Soumis à étude et validation | |||
|AttributionIdentifiant=Non | |||
|TypeIdentifiantAttribue=Identifiant interne | |||
|FormatsFichiers=Excel, PSI-MI, XML | |||
|SchemaMetadonnees=MIBBI | |||
|Licences=Creative Commons | |||
|ConditionAccesDonnees=Ouvert | |||
|Curation=http://www.imexconsortium.org/curation/ | |||
|Interoperabilite=API REST, SOAP | |||
|Versioning=Oui | |||
|StatutService=En production | |StatutService=En production | ||
|NomAlternatif= | |NomDéveloppé=Extracellular Matrix Interaction Database | ||
|UrlService= | |NomAlternatif=Extracellular Matrix Interaction Database | ||
|UrlService=https://matrixdb.univ-lyon1.fr | |||
|ContactMel=sylvie.ricard-blum@univ-lyon1.fr | |ContactMel=sylvie.ricard-blum@univ-lyon1.fr | ||
|Localisation=Villeurbanne | |Localisation=Villeurbanne | ||
|StructureAppartenance=ICBMS | |StructureAppartenance=ICBMS | ||
| | |Tutelle=CNRS, Université Claude Bernard Lyon 1 | ||
| | |IDre3data=10.17616/R3M03H | ||
|PhaseCycleVie=Analyse, Documentation, Conservation, Exposition, Réutilisation | |PhaseCycleVie=Analyse, Documentation, Conservation, Exposition, Réutilisation | ||
|International=Non | |||
}} | |||
{{Coordonnées GPS | |||
|CoordonneeGeographique=45.78155, 4.86818 | |CoordonneeGeographique=45.78155, 4.86818 | ||
}} | }} | ||
{{Service | {{Service | ||
|Description=MatrixDB est une base de données d’interactions extracellulaires protéine-protéine et protéine-glycosaminoglycanes (GAG) créée par l'équipe Assemblages Supramoléculaires Péricellulaires et Extracellulaires (ASPE) de l'ICBMS. MatrixDB est membre de l'International Molecular Exchange IMEx consortium. | |Description='''MatrixDB''' est une base de données d’interactions extracellulaires protéine-protéine et protéine-glycosaminoglycanes (GAG) créée par l'équipe Assemblages Supramoléculaires Péricellulaires et Extracellulaires (ASPE) de l'ICBMS. MatrixDB est membre de l'International Molecular Exchange IMEx consortium. | ||
MatrixDB intègre l’ensemble des interactions protéine-GAG décrites dans la littérature et et respecte les standards de curation et d’échange du consortium IMEx sous lequel sont représentées la composition et les séquences des GAGs interagissant avec les protéines. | MatrixDB intègre l’ensemble des interactions protéine-GAG décrites dans la littérature et et respecte les standards de curation et d’échange du consortium IMEx sous lequel sont représentées la composition et les séquences des GAGs interagissant avec les protéines. | ||
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MatrixDB permet la construction et la visualisation de l’interactome extracellulaire entier et de plusieurs types de réseaux d’intéractions, spécifiques d’une molécule, d’un tissu, d’une pathologie ou d’un processus biologique. | MatrixDB permet la construction et la visualisation de l’interactome extracellulaire entier et de plusieurs types de réseaux d’intéractions, spécifiques d’une molécule, d’un tissu, d’une pathologie ou d’un processus biologique. | ||
|Discipline=Vie & Santé | |Discipline=Vie & Santé | ||
|SousDisciplineVie&Sante= | |SousDisciplineVie&Sante=LS1 Molécules de la vie : Mécanismes biologiques, structures et fonctions | ||
|Thematique=Interactions extracellulaires | |Thematique=Interactions extracellulaires | ||
|ConditionUsage=Accès libre, MatrixDB est distribuée sous la licence Creative Commons Attribution Licence CC BY 4.0 | |||
|ModeleEconomique=Accès gratuit | |||
|Certification=ELIXIR Data Resources;https://elixir-europe.org/services/tag/data-resources?page=1 | |||
|ConditionUsage= | |PorteeInternationale=IMEx;http://www.imexconsortium.org/ | ||
|ModeleEconomique= | |||
|Certification= | |||
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}} | }} | ||
[[Catégorie:Catalogue CNRS Biologie]] | |||