« GenomEast » : différence entre les versions
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(Page créée avec « {{Infobox Service |Logo=Genoeast logo.jpg |NomService=GenomEast |TypeService=Plateforme de calcul |StatutService=En production |NomAlternatif=Plateforme de séquençage de Strasbourg GenomEast |UrlService=https://www.igbmc.fr/en/plateforms-and-services/platforms/genomeast |ContactMel=thibault@igbmc.fr |Localisation=Illkirch |StructureAppartenance=IGBMC, France Génomique |Tutelle=Inserm, CNRS, Université de Strasbourg |PhaseCycleVie=Planification, Analyse, Docum... ») |
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|Logo=Genoeast logo.jpg | |Logo=Genoeast logo.jpg | ||
|NomService=GenomEast | |NomService=GenomEast | ||
|TypeService=Plateforme | |TypeService=Plateforme d'acquisition | ||
|StatutService=En production | |StatutService=En production | ||
|NomAlternatif=Plateforme | |NomDéveloppé=Plateforme GenomEast | ||
|UrlService= | |NomAlternatif=Plateforme GenomEast | ||
|UrlService=http://genomeast.igbmc.fr/ | |||
|ContactMel=thibault@igbmc.fr | |ContactMel=thibault@igbmc.fr | ||
|Localisation=Illkirch | |Localisation=Illkirch | ||
|StructureAppartenance=IGBMC, France Génomique | |StructureAppartenance=IGBMC, France Génomique | ||
|Tutelle=Inserm, CNRS, Université de Strasbourg | |Tutelle=Inserm, CNRS, Université de Strasbourg | ||
|PhaseCycleVie=Planification, Analyse, Documentation | |PhaseCycleVie=Planification, Collecte, Analyse, Documentation | ||
|International=Non | |International=Non | ||
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|Description=La '''plateforme GenomEast''' propose une large gamme de '''services pour étudier les génomes, leur expression et leur régulation, depuis le contrôle qualité du matériel de départ jusqu’à l’analyse des données'''. | |Description=La '''plateforme GenomEast''' propose une large gamme de '''services pour étudier les génomes, leur expression et leur régulation, depuis le contrôle qualité du matériel de départ jusqu’à l’analyse des données'''. | ||
GenomEast propose un '''support personnalisé aux porteurs de projets pour l’analyse de leurs données''' (RNA-seq, single cell RNA-seq et ATAC-seq, small RNA-seq, ChIP-seq, Cut&Run, Cut&Tag, ATAC-seq, MEDIP-seq, DNA-seq), allant de l’analyse primaire à un large éventail d’analyses secondaires, à travers une collaboration avec les porteurs de projets. Des '''pipelines dédiés à l’analyse primaire ainsi qu’à l’analyse des données ont été développées''', en utilisant des outils publiques ou développés par la plateforme. | |||
Des '''formations en analyse de données de séquençage haut débit''' sont régulièrement organisées. | Des '''formations en analyse de données de séquençage haut débit''' sont régulièrement organisées. | ||
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|Communaute=Communauté scientifique, nationale et internationale, publique et privée | |Communaute=Communauté scientifique, nationale et internationale, publique et privée | ||
|Beneficiaire=Chercheurs, Enseignants-Chercheurs, Doctorants (public ou privé) | |Beneficiaire=Chercheurs, Enseignants-Chercheurs, Doctorants (public ou privé) | ||
|ConditionUsage=La soumission de projets s’effectue sur une interface web dédiée de la plateforme GenomEast, après ouverture d’un compte utilisateur. Il convient de joindre à chaque demande un résumé de la question scientifique posée, une description détaillée des échantillons biologiques à traiter (contrôles, répliquats...), ainsi que les coordonnées complètes du responsable du laboratoire qui finance le projet et du correspondant technique. Ces informations permettront à la plateforme de déterminer si elle est techniquement en mesure de réaliser le projet, de suggérer des modifications dans le plan expérimental et d'évaluer le coût des opérations | |Science ouverte=Politique de données | ||
|ModeleEconomique= | |Politique de données=https://seafile.igbmc.fr/f/4f92d1cc51bd48f2a4e7/ | ||
|ConditionUsage=La soumission de projets s’effectue sur une interface web dédiée de la plateforme GenomEast, après ouverture d’un compte utilisateur. Il convient de joindre à chaque demande un résumé de la question scientifique posée, une description détaillée des échantillons biologiques à traiter (contrôles, répliquats...), ainsi que les coordonnées complètes du responsable du laboratoire qui finance le projet et du correspondant technique. Ces informations permettront à la plateforme de déterminer si elle est techniquement en mesure de réaliser le projet, de suggérer des modifications dans le plan expérimental et d'évaluer le coût des opérations. | |||
|ModeleEconomique=Un devis est envoyé pour chaque demande de projet | |||
|Certification=IBiSA; https://www.ibisa.net/trouver-plateforme/, | |Certification=IBiSA; https://www.ibisa.net/trouver-plateforme/, | ||
ISO 9001:2015; https://qualite.ibisa.net/certificats/certificat_Genomeast_ISO_FR.pdf, | ISO 9001:2015; https://qualite.ibisa.net/certificats/certificat_Genomeast_ISO_FR.pdf, | ||
NFX 50-900:2016; https://qualite.ibisa.net/certificats/certificat_Genomeast_NFX_FR.pdf | NFX 50-900:2016; https://qualite.ibisa.net/certificats/certificat_Genomeast_NFX_FR.pdf, | ||
CoRTecS; https://cortecs.unistra.fr/les-plateformes/toutes-les-plateformes | |||
|Cgu=https://seafile.igbmc.fr/f/ce0536ba92e044289b3e/ | |||
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