« POPS (IPS2) » : différence entre les versions
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|StructureAppartenance=IPS2 | |StructureAppartenance=IPS2 | ||
|Tutelle=Université Paris-Saclay | |Tutelle=Université Paris-Saclay | ||
|PhaseCycleVie=Collecte, Analyse | |PhaseCycleVie=Collecte, Analyse, Documentation | ||
|International=Non | |International=Non | ||
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{{Service | {{Service | ||
|Description='''POPS''' est la plateforme de transcriptomique des plantes de Paris-Saclay localisée à l'institut de science des plantes Paris-Saclay (IPS2). Elle offre une expertise pour le développement de l’'''analyse du transcriptome chez les végétaux par l’utilisation du séquençage à haut débit d’ARN (RNA-Seq)'''. Leur savoir-faire s’étend de la préparation des échantillons à l’analyse bioinformatique et statistiques des données. | |Description='''POPS''' est la plateforme de transcriptomique des plantes de Paris-Saclay localisée à l'institut de science des plantes Paris-Saclay (IPS2). Elle offre une expertise pour le développement de l’'''analyse du transcriptome chez les végétaux par l’utilisation du séquençage à haut débit d’ARN (RNA-Seq)'''. Leur savoir-faire s’étend '''de la préparation des échantillons à l’analyse bioinformatique et statistiques des données.''' | ||
Elle propose : | Elle propose : | ||
1. Une expertise pour l’'''analyse de l’expression des gènes chez les plantes par l’utilisation du séquençage à haut-débit de l’ARN'''. Cette offre est complétée par l’'''analyse bioinformatique et statistique permettant l’analyse quantitative du transcriptome'''. | 1. Une expertise pour l’'''analyse de l’expression des gènes chez les plantes par l’utilisation du séquençage à haut-débit de l’ARN'''. Cette offre est complétée par l’'''analyse bioinformatique et statistique permettant l’analyse quantitative du transcriptome'''. | ||
2. Du développement méthodologique afin de répondre au mieux aux demandes de nos collaborateurs et d’élargir | 2. Du développement méthodologique afin de répondre au mieux aux demandes de nos collaborateurs et d’élargir l'offre de service. | ||
3. Des formations et de l’animation scientifique | 3. Des formations et de l’animation scientifique | ||
|Discipline=Vie & Santé | |Discipline=Vie & Santé | ||
| Ligne 28 : | Ligne 28 : | ||
|Thematique=Plateforme de bioinformatique, Organismes végétaux, RNAseq, Transcriptomique, SingleCell, Microtranscriptomique, Séquençage ARN | |Thematique=Plateforme de bioinformatique, Organismes végétaux, RNAseq, Transcriptomique, SingleCell, Microtranscriptomique, Séquençage ARN | ||
|TypeDonnee=Données génomiques, Données de séquençage | |TypeDonnee=Données génomiques, Données de séquençage | ||
|Beneficiaire=Chercheurs, Enseignants-Chercheurs, Biologistes | |||
|ConditionUsage=Pour soumettre un projet à la plateforme POPS, il est possible d'envoyer un mail à pops.ips2@universite-paris-saclay.fr en décrivant brièvement le projet. Après une première prise de contact permettant d’étudier la faisabilité du projet, une réunion téléphonique ou sur site sera proposée, afin de définir les objectifs et les questions biologiques, d’établir un plan d’expérience... Les collaborateurs et experts concernés de la plateforme seront présents à cette réunion. Le délai de réalisation des projets varie selon le type d’analyse, le nombre d’échantillons et le taux d’occupation de la plateforme. | |ConditionUsage=Pour soumettre un projet à la plateforme POPS, il est possible d'envoyer un mail à pops.ips2@universite-paris-saclay.fr en décrivant brièvement le projet. Après une première prise de contact permettant d’étudier la faisabilité du projet, une réunion téléphonique ou sur site sera proposée, afin de définir les objectifs et les questions biologiques, d’établir un plan d’expérience... Les collaborateurs et experts concernés de la plateforme seront présents à cette réunion. Le délai de réalisation des projets varie selon le type d’analyse, le nombre d’échantillons et le taux d’occupation de la plateforme. | ||
|Certification=ISO 9001:2015; | |Certification=ISO 9001:2015; | ||