« Genoscope » : différence entre les versions

Genoscope (voir la source)

Version du 13 décembre 2024 à 10:10

324 octets enlevés , 13 décembre 2024

aucun résumé des modifications

SidonieRaffy

12 701

modifications

@@ Ligne 19 : / Ligne 19 : @@
 }}
 {{ServiceStructure
-|Description=L'équipe du '''laboratoire de séquençage du Genoscope''' s'implique dans la prise en main des projets à partir de la réception des échantillons jusqu'à la validation des séquences brutes. Le séquençage est assuré par des séquenceurs très haut débit de deuxième génération. Ces machines permettent d'atteindre un débit autorisant le séquençage de génomes entiers dans un intervalle de temps limité.
+|Description=L'équipe du '''laboratoire de séquençage du Genoscope''' s'implique dans la prise en main des projets à partir de la réception des échantillons jusqu'à la validation des séquences brutes.
+Il s’est orienté vers l’étude de la biodiversité, à travers le séquençage de novo de grands génomes complets, de metagénomes complexes et plus généralement de collections d’ADN nécessitant une approche de séquençage à très grande échelle.
-Les projets actuellement développés concernent un large panel d'organismes, par exemple :
+Une équipe de chercheurs se consacre aussi au '''développement et optimisation de nouvelles stratégies de séquençage''', y compris l’essai et valorisation des données issus de séquenceurs de troisième génération : lectures ultra longues, modifications épigénétiques, stratégies read-until, etc.
-* Reséquençage : champignon unicellulaire comme la levure (Saccharomyces cerevisiae) ou organisme végétal comme le riz (genre Oryza),
-* Séquençage de novo de protiste (Paramecia), d'organisme animal comme la limnée (genre Lymnaea) ou d'organisme végétal comme le blé (genre Triticum),
-* Séquençage de transcriptomes d'organismes eucaryotes comme le chêne (genre Quercus),
-* Projets de métagénomique et de métatranscriptomique (projets Tara Océans, biodiversité des sols français)
-* Projets de séquençage du Génome de la truffe noire du Périgord, du génome d'Ectocarpus.
-* 1002 génomes de levures, biodiversité des plantes alpines.
 |Discipline=Vie & Santé
-|SousDisciplineVie&Sante=LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes
+|SousDisciplineVie&Sante=LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes; LS8 Biologie environnementale, écologie et évolution
-|Thematique=Plateforme de bioinformatique
+|Thematique=Plateforme de bioinformatique, Biodiversité
-|TypeDonnee=Données génomiques
+|TypeDonnee=Données génomiques, Données de séquençage
 |Communaute=Communautés scientifiques académiques
 |Beneficiaire=Chercheurs, Enseignants-Chercheurs, Médecins