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« PRABI Lyon-Gerland » : différence entre les versions
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{{Infobox Service | {{Infobox Service | ||
|Logo=PRABI.png | |||
|NomService=PRABI Lyon-Gerland | |NomService=PRABI Lyon-Gerland | ||
|TypeService=Plateforme de calcul | |TypeService=Plateforme de calcul | ||
|StatutService=En production | |StatutService=En production | ||
|NomAlternatif=Pôle Rhônes-Alpes de Bioinformatique, PRABI Gerland | |NomAlternatif=Pôle Rhônes-Alpes de Bioinformatique, PRABI site de Lyon-Gerland, Pôle Bio-Informatique Lyonnais, PBIL | ||
|UrlService=https://prabi.ibcp.fr/ | |UrlService=https://prabi.ibcp.fr/ | ||
|ContactMel=gilbert.deleage@ibcp.fr , raphael.terreux@ibcp.fr | |ContactMel=gilbert.deleage@ibcp.fr , raphael.terreux@ibcp.fr | ||
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|Description=PRABI Lyon-Gerland localisé à l'Institut de Biologie et Chimie des Protéines (IBCP), est une plateforme de bioinformatique spécialisée dans l’analyse des données génomiques, transcriptomiques et métagénomiques, avec une prise en compte forte des aspects écologiques et évolutifs. | |Description=PRABI Lyon-Gerland localisé à l'Institut de Biologie et Chimie des Protéines (IBCP), est une plateforme de bioinformatique spécialisée dans l’analyse des données génomiques, transcriptomiques et métagénomiques, avec une prise en compte forte des aspects écologiques et évolutifs. | ||
Le PRABI-Gerland développe les bases de données dans le domaine infectieux, les méthodes de prédiction et d'optimisation des structures 3D de protéines ainsi que les outils et services s'y rapportant. Dans le domaine des services la spécificité de la plateforme est la bioinformatique structurale (Modélisation moléculaire, prédiction de structure). | Le PRABI-Gerland développe : | ||
*Différentes méthodes dédiées à la prédiction de structures secondaires des protéines | |||
*Des outils de détection de motifs flous dans les séquences protéiques | |||
*Des outils de modélisation automatique de structures 3D de protéines [Geno3D] | |||
*Un logiciel d’analyse de séquences protéiques (sous Windows) (ANTHEPROT) | |||
*Un service web intégré (NPS@) | |||
*Un algorithme de recherche de similarité de sites 3D dans les structures de protéines (SuMo) | |||
les bases de données dans le domaine infectieux, les méthodes de prédiction et d'optimisation des structures 3D de protéines ainsi que les outils et services s'y rapportant. Dans le domaine des services la spécificité de la plateforme est la bioinformatique structurale (Modélisation moléculaire, prédiction de structure). | |||
|Discipline=Vie & Santé | |Discipline=Vie & Santé | ||
|SousDisciplineVie&Sante=LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes | |SousDisciplineVie&Sante=LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes | ||
|Thematique=Plateforme de bioinformatique,Bioinformatique structurale, Prédiction de structure, Base de données structurales, Analyse de séquences, Modélisation moléculaire, Docking moléculaire | |Thematique=Plateforme de bioinformatique,Bioinformatique structurale, Prédiction de structure, Base de données structurales, Analyse de séquences, Modélisation moléculaire, Docking moléculaire | ||
|Certification=RIO,IBiSA;http://www.ibisa.net/plateformes/ | |Certification=RIO,IBiSA;http://www.ibisa.net/plateformes/ | ||
|Relation=France Génomique, FRISBI, CNRS Biologie | |Relation=France Génomique, FRISBI, CNRS Biologie, IBCP | ||
|PorteeInternationale=ELIXIR;https://elixir-europe.org/ | |PorteeInternationale=ELIXIR;https://elixir-europe.org/ | ||
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[[Catégorie:Catalogue CNRS Biologie]] | [[Catégorie:Catalogue CNRS Biologie]] | ||