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(Page créée avec « {{Infobox Service |Logo=PPanGGOLiN logo.png |NomService=PPanGGOLiN |TypeService=Outils de gestion des données |StatutService=En production |NomAlternatif=Depicting microbial species diversity via a Partitioned PanGenome Graph Of Linked Neighbors |UrlService=https://github.com/labgem/PPanGGOLiN |ContactMel=acalteau@genoscope.cns.fr |StructureAppartenance=LABGeM |Tutelle=CEA |PhaseCycleVie=Analyse }} {{Service |Discipline=Vie & Santé |SousDisciplineVie&Sante=LS2... ») |
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{{Service | {{Service | ||
|Description=PPanGGOLiN est un logiciel de bioinformatique dédié à l'analyse de pangénomes. Il permet de '''créer, manipuler et analyser des pangénomes procaryotes''' en utilisant des dizaines voire des milliers de génomes d'une même espèce. Il permet ainsi d'étudier l'évolution ou l'écologie des microbes, ouvrant la voie à des découvertes importantes pour la santé humaine, l'agriculture, l'alimentation ou l'environnement. | |||
Le code source du logiciel PPanGGOLiN, en langage Python, a ainsi considérablement évolué depuis sa création avec notamment l'ajout de nouvelles méthodes d'analyses de régions de plasticité génomique. | |||
Le laboratoire LABGeM a également intégré l'outil dans sa plateforme de service, MicroScope, mis à disposition des microbiologistes et qui comprend plus de 6600 utilisateurs à travers le monde. | |||
|Discipline=Vie & Santé | |Discipline=Vie & Santé | ||
|SousDisciplineVie&Sante=LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes | |SousDisciplineVie&Sante=LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes | ||
|StatutPage=Page en construction | |StatutPage=Page en construction | ||
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