Aller au contenu

« AuBI » : différence entre les versions

212 octets ajoutés ,  9 novembre 2023
aucun résumé des modifications
Aucun résumé des modifications
Aucun résumé des modifications
Ligne 20 : Ligne 20 :
Le Mésocentre Clermont Auvergne fournit un accès à des banques de données biologiques publiques. Leurs mises à jours sont gérées par [https://biomaj.genouest.org/ BioMAJ]. Les données brutes proviennent de sites distants (NCBI, flybase, ensembl, ...) et sont indexées automatiquement en local pour être utilisées ensuite par les différents outils sur le cluster de calcul HPC2 ou via le serveur web Galaxy.
Le Mésocentre Clermont Auvergne fournit un accès à des banques de données biologiques publiques. Leurs mises à jours sont gérées par [https://biomaj.genouest.org/ BioMAJ]. Les données brutes proviennent de sites distants (NCBI, flybase, ensembl, ...) et sont indexées automatiquement en local pour être utilisées ensuite par les différents outils sur le cluster de calcul HPC2 ou via le serveur web Galaxy.


La liste des banques de données disponibles et les informations afférentes sont accessibles grâce à l'interface [https://biodatabanks.mesocentre.uca.fr/app/#/bank BioMAJWatcher].
La liste des banques de données disponibles et les informations afférentes sont accessibles grâce à l'interface [https://biodatabanks.mesocentre.uca.fr/app/#/bankBioMAJWatcher].
 
Deux services web sont proposés par AuBI :
* '''Galaxy''', pour y conduire des analyses de transcriptomique, génomique, métagénomique
* '''OMERO''', pour le stockage d'images et des métadonnées associées
|Discipline=Vie & Santé
|Discipline=Vie & Santé
|SousDisciplineVie&Sante=LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes
|SousDisciplineVie&Sante=LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes