EcoTaxa

EcoTaxa
Type de service	Plateforme d'accès
Statut	En production
URL	https://ecotaxa.obs-vlfr.fr/
Contact	marc.picheral@obs-vlfr.fr
Localisation	Villefranche-sur-Mer
Structure d'appartenance	IMEV
Tutelles	CNRS, Sorbonne Université

EcoTaxa est une application web qui permet de stocker et classer des images d'organismes individuels, principalement du plancton, en utilisant une taxonomie de référence. Les images et les métadonnées associées aux organismes qu'elles représentent sont chargées dans l'application afin de prédire leur identification (classification automatique). Les utilisateurs enregistrés peuvent ensuite valider cette classification ou améliorer le tri en visualisant celles-ci via un interface web dédié. Toutes les activités sont enregistrées afin de permettre un contrôle qualité. ECOTAXA accueille aujourd'hui plus de 50 millions d'images acquises avec différents types d'instruments. Environ 30% sont déjà validées. Ecotaxa est aujourd'hui la plus grande base d'images de plancton triée.

L'application web EcoTaxa est hébergée et maintenue par la plateforme d’imagerie quantitative de Villefranche-sur-Mer - PIQv (Laboratoire d'Océanographie de Villefranche LOV - Institut de la Mer de Villefranche IMEV dédiée à l’analyse d’imagerie quantitative du plancton et des détritus aquatiques. Cette plateforme est intégrée dans l’offre de services de l’Infrastructure de Recherche EMBRC-France, nœud français d’EMBRC.

Domaines scientifiques :Vie & Santé

LS3 Biologie cellulaire, du développement et régénérative; Ecologie, évolution et biologie environnementale« Ecologie, évolution et biologie environnementale » n’est pas dans la liste (LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes, LS3 Biologie cellulaire, du développement et régénérative, LS4 Physiologie de la santé, de la maladie et du vieillissement, LS5 Neurosciences et troubles du système nerveux, LS6 Immunité, infection et immunothérapie, LS7 Prévention, diagnostic et traitement des maladies humaines, LS8 Biologie environnementale, écologie et évolution, LS9 Biotechnologie et ingénierie des biosystèmes, LS1 Molécules de la vie : Mécanismes biologiques, structures et fonctions) des valeurs autorisées pour la propriété « Est sous discipline de Vie & Santé ». Thématique et/ou mots clés :

Plancton
Imagerie quantitative

Type de données :Images

Communauté d'utilisateurs : Usagers et bénéficiaires :

Conditions d'usage : Accès libre. Accès avec login/mot de passe. Cependant la création d'un compte n'est pas nécessaire pour la simple consultation, mais obligatoire pour la contribution.

Conditions tarifaires : Accès gratuit

Certification/Label :

Conditions générales d'utilisation :

EcoTaxa est en lien avec les services et structures

EMBRC-France, Tara Océan

Services proposés par la structure d'appartenance

Structure	Services proposés
IMEV	EcoTaxa MICA