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« CAZy » : différence entre les versions
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Remplacement de texte — « Biologie moléculaire, biochimie, biologie structurale et biophysique moléculaire » par « LS1 Molécules de la vie : Mécanismes biologiques, structures et fonctions »
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|Description=En 1998, la base de données '''Carbohydrate-Active enZYmes Database''' (CAZy) est créée et mise à jour par l’équipe Glycogénomique du laboratoire Architecture et Fonction des Macromolécules Biologiques (AFMB). L’objectif de CAZy est d’établir les relations entre la séquence des enzymes qui agissent sur les hydrates de carbone et leur spécificité. '''Les enzymes actives sur les glucides''' (CAZymes) modifient, créent ou lysent les liaisons glycosidiques des sucres complexes et des polysaccharides qui sont utilisés par les êtres vivants. Ces glucides peuvent jouer le rôle de source de carbone, de signaux moléculaires spécifiques, de stockage de l’énergie ou intervenir dans les interactions hôtes-pathogènes. L’équipe Glycogénomique a développé une classification en familles qui relie la structure et le mécanisme catalytique des '''CAZymes'''. Cette classification est composée de 5 '''classes d’enzymes''' (glycoside hydrolases, glycosyltransférases, carbohydrate estérases, polysaccharide lyases et les enzymes dites à activités auxiliaires). Les modules de fixation aux sucres (Carbohydrate-Binding Modules) figurent également dans cette base de données. Un couplage entre la base de données CAZy et les moyens en '''bioinformatique''' permet d’examiner le contenu en CAZymes de centaines de génomes eucaryotes et procaryotes. La classification CAZy est largement utilisée par la communauté scientifique pour ses '''données annotées''' ('''annotations structurales et fonctionnelles''' des protéines issues de GenBank, UniProt, Protein Data Bank). | |Description=En 1998, la base de données '''Carbohydrate-Active enZYmes Database''' (CAZy) est créée et mise à jour par l’équipe Glycogénomique du laboratoire Architecture et Fonction des Macromolécules Biologiques (AFMB). L’objectif de CAZy est d’établir les relations entre la séquence des enzymes qui agissent sur les hydrates de carbone et leur spécificité. '''Les enzymes actives sur les glucides''' (CAZymes) modifient, créent ou lysent les liaisons glycosidiques des sucres complexes et des polysaccharides qui sont utilisés par les êtres vivants. Ces glucides peuvent jouer le rôle de source de carbone, de signaux moléculaires spécifiques, de stockage de l’énergie ou intervenir dans les interactions hôtes-pathogènes. L’équipe Glycogénomique a développé une classification en familles qui relie la structure et le mécanisme catalytique des '''CAZymes'''. Cette classification est composée de 5 '''classes d’enzymes''' (glycoside hydrolases, glycosyltransférases, carbohydrate estérases, polysaccharide lyases et les enzymes dites à activités auxiliaires). Les modules de fixation aux sucres (Carbohydrate-Binding Modules) figurent également dans cette base de données. Un couplage entre la base de données CAZy et les moyens en '''bioinformatique''' permet d’examiner le contenu en CAZymes de centaines de génomes eucaryotes et procaryotes. La classification CAZy est largement utilisée par la communauté scientifique pour ses '''données annotées''' ('''annotations structurales et fonctionnelles''' des protéines issues de GenBank, UniProt, Protein Data Bank). | ||
|Discipline=Vie & Santé | |Discipline=Vie & Santé | ||
|SousDisciplineVie&Sante= | |SousDisciplineVie&Sante=LS1 Molécules de la vie : Mécanismes biologiques, structures et fonctions; LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes | ||
|Thematique=Base de données, Carbohydrate-Active enZYmes , Enzymes actives sur les glucides, CAZymes, Glycoside hydrolases, Glycosyltransférases, Carbohydrate estérases, Polysaccharide lyases, Carbohydrate-Binding Modules, Catalyse enzymatique, Génomique, Bioinformatique | |Thematique=Base de données, Carbohydrate-Active enZYmes , Enzymes actives sur les glucides, CAZymes, Glycoside hydrolases, Glycosyltransférases, Carbohydrate estérases, Polysaccharide lyases, Carbohydrate-Binding Modules, Catalyse enzymatique, Génomique, Bioinformatique | ||
|TypeDonnee=Données annotées, Séquençage des protéines, Séquençage du génome, Structure moléculaire, Structure 3D, Relation structure activité, Activité enzymatique | |TypeDonnee=Données annotées, Séquençage des protéines, Séquençage du génome, Structure moléculaire, Structure 3D, Relation structure activité, Activité enzymatique | ||