AuReMe

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AuReMe
Type de service Outils de gestion des données
Statut En production
Autres noms AUtomated REconstruction of MEtabolic models
URL http://aureme.genouest.org/index.html
Contact gem-aureme@inria.fr
Localisation Rennes
Structure d'appartenance Dyliss
Tutelles


Cycle de vie des données

Ce service intervient au cours des stades du cycle de vie suivants :


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AuReMe, AUtomated REconstruction of MEtabolic models, est un espace de travail modulaire et adaptable pour la reconstruction reproductible de modèles métaboliques à l'échelle génomique. L'espace de travail permet d'explorer, de visualiser et de distribuer les modèles à l'échelle du génome et leurs métadonnées par la génération de wikis locaux. AuReMe est construit autour d'un paquet Python PADMet (Python library for hAndling metaData of METabolism), pour abriter la reconstruction de la reconstruction de modèles métaboliques à l'échelle du génome (GSMs).


Domaines scientifiques :Sciences & Technologies, Vie & Santé


Sciences informatiques et informatique« Sciences informatiques et informatique » n’est pas dans la liste (PE1 Mathématiques, PE2 Constituants fondamentaux de la matière, PE3 Physique de la matière condensée, PE4 Chimie physique et analytique, PE5 Chimie de synthèse et matériaux, PE6 Sciences informatiques et informatique, PE7 Ingénierie des systèmes et de la communication, PE8 Ingénierie des produits et des procédés, PE9 Sciences de l'Univers, PE10 Sciences du Système Terre, ...) des valeurs autorisées pour la propriété « Est sous discipline de Sciences & Technologies ». Génétique, "omiques", bioinformatique et biologie des systèmes« Génétique, "omiques", bioinformatique et biologie des systèmes » n’est pas dans la liste (LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes, LS3 Biologie cellulaire, du développement et régénérative, LS4 Physiologie de la santé, de la maladie et du vieillissement, LS5 Neurosciences et troubles du système nerveux, LS6 Immunité, infection et immunothérapie, LS7 Prévention, diagnostic et traitement des maladies humaines, LS8 Biologie environnementale, écologie et évolution, LS9 Biotechnologie et ingénierie des biosystèmes, LS1 Molécules de la vie : Mécanismes biologiques, structures et fonctions) des valeurs autorisées pour la propriété « Est sous discipline de Vie & Santé ». Thématique et/ou mots clés :


Type de données :

Communauté d'utilisateurs : Usagers et bénéficiaires :


Conditions d'usage :

Conditions tarifaires :

Certification/Label :

Conditions générales d'utilisation :



Services proposés par la structure d'appartenance
StructureServices proposés
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