« UCA Genomix » : différence entre les versions
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{{Infobox Service | {{Infobox Service | ||
|Logo=UCAGenomics logo.jpg | |Logo=UCAGenomics logo.jpg | ||
|NomService= | |NomService=UCA Genomix | ||
|TypeService=Plateforme d'acquisition | |TypeService=Plateforme d'acquisition | ||
|StatutService=En production | |StatutService=En production | ||
|UrlService=https://www.france-genomique.org/plateformes-et-equipements/plateforme-genomique-fonctionnelle-ucagenomix-nice-sophia-antipolis/ | |NomDéveloppé=Université Côte d'Azur Genomix | ||
|NomAlternatifRéduit=Plateforme de génomique fonctionnelle de Nice-Sophia Antipolis | |||
|NomAlternatif=Université Côte d'Azur Genomix, Plateforme de génomique fonctionnelle de Nice-Sophia Antipolis | |||
|UrlService=https://www.france-genomique.org/plateformes-et-equipements/plateforme-genomique-fonctionnelle-ucagenomix-nice-sophia-antipolis/, https://www.ipmc.cnrs.fr/cgi-bin/site.cgi | |||
|ContactMel=plateforme@ipmc.cnrs.fr | |ContactMel=plateforme@ipmc.cnrs.fr | ||
|Localisation=Valbonne Sophia Antipolis | |Localisation=Valbonne Sophia Antipolis | ||
|StructureAppartenance=France Génomique | |StructureAppartenance=France Génomique, IPMC | ||
|Tutelle=CNRS | |Tutelle=CNRS, Université Côte d'Azur | ||
|PhaseCycleVie=Collecte, Analyse | |PhaseCycleVie=Collecte, Analyse, Documentation, Stockage | ||
|International=Non | |International=Non | ||
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{{Service | {{Service | ||
|Description=La '''plateforme UCAGenomiX''' | |Description=La '''plateforme UCAGenomiX''' fournit une expertise en '''transcriptomique, bioinformatique et génomique fonctionnelle''', allant de la conception expérimentale des expériences jusqu'aux analyses bioinformatiques primaires et secondaires et leur interprétation biologique. | ||
Elle met en œuvre tout un panel d’'''expériences en génomique''' (DNA-Seq, Chip-Seq, RNA-Seq, CLIP-Seq) avec une spécialisation dans le profilage -omique sur cellule unique (single cell RNA-Seq, CNV-Seq, ATAC-Seq). Les résultats sont '''stockés automatiquement sur le portail d’informations de la plateforme Médiante'''. | |||
Elle propose une expertise en génomique fonctionnelle : | |||
* '''Conception expérimentale des expériences''' | |||
* '''Analyse bioinformatique primaire et secondaire''' des résultats | |||
* '''Aide à leur interprétation biologique''' | |||
La plateforme développe en permanence de nouvelles expertises, en interne ou au travers de collaborations scientifiques. | |||
|Discipline=Vie & Santé | |Discipline=Vie & Santé | ||
|SousDisciplineVie&Sante=LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes | |SousDisciplineVie&Sante=LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes | ||
|Thematique=Plateforme de bioinformatique | |Thematique=Plateforme de génomique, Plateforme de bioinformatique, Séquençage | ||
|TypeDonnee=Données de séquençage | |TypeDonnee=Données de séquençage, Données génomiques | ||
|Communaute=Communautés scientifiques académiques et médicales et laboratoires privés dans le domaine de la génomique. | |||
|Beneficiaire=Chercheurs, Enseignants-Chercheurs, Médecins | |||
|ConditionUsage=Les demandes de séquençage à haut-débit doivent être déposées sur le portail de l’infrastructure nationale France Genomique. Elles sont évaluées et validées au cas par cas par le comité scientifique d’UCAGenomiX, puis transférées sur le système d’information de la plateforme, Mediante, qui permet un échange sécurisé des données et des résultats. | |ConditionUsage=Les demandes de séquençage à haut-débit doivent être déposées sur le portail de l’infrastructure nationale France Genomique. Elles sont évaluées et validées au cas par cas par le comité scientifique d’UCAGenomiX, puis transférées sur le système d’information de la plateforme, Mediante, qui permet un échange sécurisé des données et des résultats. | ||
|Certification=ISO 9001- | |Certification=ISO 9001:2015; https://www.france-genomique.org/plateformes-et-equipements/plateforme-genomique-fonctionnelle-ucagenomix-nice-sophia-antipolis/, | ||
IBiSA; https://www.ibisa.net/trouver-plateforme/ | IBiSA; https://www.ibisa.net/trouver-plateforme/ | ||
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