Bureaucrates, emailconfirmed, Administrateurs d’interface, Administrateurs (MediaWiki Sémantique), Conservateurs (MediaWiki Sémantique), Modificateurs (MediaWiki Sémantique), Masqueurs de modifications, Administrateurs
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(Page créée avec « {{Infobox Service |Logo=BiP-logo2.png |NomService=BiP |TypeService=Plateforme de calcul |StatutService=En production |NomDéveloppé=Bioinformatics Platform |UrlService=https://www.ibmp.cnrs.fr/plateformes/bioinformatique/ |ContactMel=Valerie.cognat@ibmp.unistra.fr |Localisation=Strasbourg |StructureAppartenance=IBMP |Tutelle=CNRS, Université de Strasbourg |PhaseCycleVie=Collecte, Analyse |International=Non }} {{Service |Description=La plateforme de bioinformati... ») |
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|StructureAppartenance=IBMP | |StructureAppartenance=IBMP | ||
|Tutelle=CNRS, Université de Strasbourg | |Tutelle=CNRS, Université de Strasbourg | ||
|PhaseCycleVie=Collecte, Analyse | |PhaseCycleVie=Collecte, Analyse, Stockage | ||
|International=Non | |International=Non | ||
}} | |||
{{Coordonnées GPS | |||
|CoordonneeGeographique=48.58082, 7.7636 | |||
}} | }} | ||
{{Service | {{Service | ||
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'''Missions:''' | '''Missions:''' | ||
* Analyse de données biologiques | |||
* Mise en place des ressources de calcul en bioinformatique | |||
* Formation à destination de biologistes ou bioinformaticiens (Accès aux formations). | |||
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La plateforme possède des compétences en analyses de données NGS, plus particulièrement Illumina et Nanopore. Elles couvrent différentes thématiques, entre autres : | La plateforme possède des compétences en analyses de données NGS, plus particulièrement Illumina et Nanopore. Elles couvrent différentes thématiques, entre autres : | ||
* l’assemblage de génomes | |||
* la détection de variants | |||
* l’étude du transcriptome (RNA-seq et smallRNA-seq) | |||
* la métagénomique 16S | |||
* les interactions protéines/adn-arn (ChIP-seq, ….) | |||
* la méthylation | |||
La plateforme travaille en synergie avec la plateforme AEG pour une prise globale des projets de la définition du plan expérimental à l’exploitation des résultats. | |||
|Discipline=Vie & Santé | |Discipline=Vie & Santé | ||
|TypeDonnee=Données biologiques | |SousDisciplineVie&Sante=LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes | ||
Données de séquençage haut débit | |Thematique=Plateforme de bioinformatique, Séquençage haut débit | ||
|TypeDonnee=Données biologiques, Données de séquençage haut débit | |||
|Communaute=Communautés scientifiques de l'ensemble des établissements partenaires | |||
|Beneficiaire=Chercheurs ; Enseignants-chercheurs ; Doctorants | |||
|ConditionUsage=Chaque personne travaillant dans un institut partenaire peut faire une demande de compte sur les ressources de calcul via le Formulaire d’ouverture de compte. | |ConditionUsage=Chaque personne travaillant dans un institut partenaire peut faire une demande de compte sur les ressources de calcul via le Formulaire d’ouverture de compte. | ||
Les personnes travaillant dans un institut non partenaire peuvent contacter le responsable de plateforme pour une demande de partenariat. | Les personnes travaillant dans un institut non partenaire peuvent contacter le responsable de plateforme pour une demande de partenariat. | ||
|Certification= | |Certification=CoRTecS; https://cortecs.unistra.fr/les-plateformes/toutes-les-plateformes/detail/57-plateforme-de-bioinformatique | ||
|Cgu=https://www.ibmp.cnrs.fr/app/uploads/2021/02/Charte-Fonctionnement_HPC_IBMP.pdf | |||
|Relation=FBI | |||
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