« ENA » : différence entre les versions

ENA
Type de service	Entrepôt de données
Caractéristiques de l'entrepôt
Type d’entrepôt	Disciplinaire
Type de restriction	Soumis à la création d'un compte
Hébergement des données	UE
Identifiant pérenne	✓
Identifiants fournis	ID interne, BioSample
Identifiants utilisés
Formats de fichiers acceptés
Schéma de métadonnées
Licence des jeux de données	Creative Commons
Conditions d'accès aux données	Ouvert, Embargo
Modération / Curation	Les métadonnées sont modérées automatiquement via une checklist, à laquelle s'ajoute une vérification manuelle selon les cas. Il y a une prise de contact en direct avec les contributeurs dans certains cas.
Volumétrie maximale définie
Politique de conservation des données	Cet entrepôt existe depuis 1985.
Interopérabilité machine	API REST, FTP
Versioning	✓
Statut	En production
Autres noms	European Nucleotide Archive, Archive européenne des nucléotides
URL	https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/home
Contact	https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/support
Localisation	Saffron Walden (Royaume-Uni)
Structure d'appartenance	EMBL-EBI
Tutelles
Identifiants
re3data	10.17616/R3HW3J
Identifiant dans un autre catalogue	https://doi.org/10.25504/FAIRsharing.dj8nt8 (FAIRsharing)

Dernière version du 23 octobre 2024 à 09:34

L'Archive européenne des nucléotides (ENA) capture et présente les informations relatives aux flux de travail expérimentaux basés sur le séquençage des nucléotides. Elle enregistre ces informations dans un modèle de données qui couvre les informations d'entrée, les données de sortie de la machine et les informations interprétées.

Les données qui parviennent à l'ENA proviennent de différentes sources. Il s'agit notamment de données brutes, de séquences assemblées et d'annotations provenant d'efforts de séquençage à petite échelle, de données fournies par les principaux centres de séquençage européens et d'échanges réguliers et complets avec nos partenaires de l'International Nucleotide Sequence Database Collaboration (INSDC).

Dans le cadre de l'effort mondial visant à améliorer l'accès aux données de séquençage de nucléotides et leur utilisation, l'ENA collabore largement au développement de nos services et de nos technologies, ainsi qu'aux activités de normalisation.

Domaines scientifiques :Vie & Santé

LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes Thématique et/ou mots clés :

Biologie moléculaire
Génomique

Type de données :Séquences nucléotidiques, Données brutes, Annotations

Communauté d'utilisateurs : Communauté de recherche en sciences de la vie Usagers et bénéficiaires :Chercheurs, Enseignants-Chercheurs, Doctorants

Conditions d'usage :

Conditions tarifaires : Gratuit

Certification/Label :CoSO (https://www.ouvrirlascience.fr/selectionner-un-entrepot-thematique-de-confiance-pour-le-depot-de-donnees-methodologie-et-analyse-de-loffre-existante/)

Conditions générales d'utilisation : https://www.ebi.ac.uk/about/terms-of-use/

Portée internationale de ENA

ELIXIR (https://www.elixir-europe.org/)

Global Core Biodata Resources (https://globalbiodata.org/what-we-do/global-core-biodata-resources/)

Services proposés par la structure d'appartenance

Structure	Services proposés
EMBL-EBI	ENA PRIDe

@@ Ligne 4 : / Ligne 4 : @@
 |TypeService=Entrepôt de données
 |TypeEntrepot=Disciplinaire
+|TypeRestriction=Soumis à la création d'un compte
+|HebergementDonnees=UE
+|AttributionIdentifiant=Oui
+|TypeIdentifiantAttribue=ID interne, BioSample
 |Licences=Creative Commons
 |ConditionAccesDonnees=Ouvert, Embargo
+|Curation=Les métadonnées sont modérées automatiquement via une checklist, à laquelle s'ajoute une vérification manuelle selon les cas. Il y a une prise de contact en direct avec les contributeurs dans certains cas.
+|ConservationDonnees=Cet entrepôt existe depuis 1985.
 |Interoperabilite=API REST, FTP
 |Versioning=Oui
@@ Ligne 12 : / Ligne 18 : @@
 |UrlService=https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/home
 |ContactMel=https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/support
+|Localisation=Saffron Walden (Royaume-Uni)
 |StructureAppartenance=EMBL-EBI
 |IDre3data=10.17616/R3HW3J
 |IdentifiantAlternatif=https://doi.org/10.25504/FAIRsharing.dj8nt8; FAIRsharing
 |PhaseCycleVie=Documentation, Conservation, Exposition, Réutilisation
-|International=Non
+|International=Oui
+}}
+{{Coordonnées GPS
+|CoordonneeGeographique=52.07895, 0.18663
 }}
 {{Service
-|Description=L''''Archive européenne des nucléotides (ENA)''' est une plateforme ouverte et soutenue pour la gestion, le partage, l'intégration, l'archivage et la diffusion des données de séquence.
+|Description=L''''Archive européenne des nucléotides (ENA)''' capture et présente les informations relatives aux '''flux de travail expérimentaux basés sur le séquençage des nucléotides'''. Elle enregistre ces informations dans un modèle de données qui couvre les informations d'entrée, les données de sortie de la machine et les informations interprétées.
-Base de données d'enregistrement et plateforme de gestion des données : L'ENA comprend à la fois la ressource de données globale qui préserve la production mondiale de données de séquence dans le domaine public (pour en savoir plus sur le contenu de l'ENA, cliquez ici) et un riche portefeuille d'outils et de services pour soutenir la gestion des données de séquence.
-Une base de données : alors que le séquençage des nucléotides devient de plus en plus central dans des domaines appliqués tels que les soins de santé et les sciences de l'environnement, l'ENA est devenu une base sur laquelle la compréhension scientifique des systèmes biologiques peut être assemblée. Nos utilisateurs sont des fournisseurs de données, des coordinateurs de données pour des études basées sur le séquençage, des consommateurs directs de données et des fournisseurs de services secondaires (par exemple, UniProt, RNAcentral, EBI Metagenomics, Ensembl, Ensembl Genomes, ArrayExpress) qui s'appuient sur les services et le contenu de l'ENA.
-Coordination des données : nos partenariats de coordination des données couvrent les sciences de la vie, notamment la génomique du bétail, la biotechnologie marine, la biodiversité, la surveillance des agents pathogènes et la biologie des cellules souches. Dans le cadre de ces partenariats, nous soutenons les opérations de données en fournissant des technologies, des normes, des analyses de données, des formations, une assistance et des portails de données web/API. Pour en savoir plus, cliquez ici.
-Ambition : nous nous engageons à développer l'utilité de la plateforme ENA et à faire en sorte que la technologie et les données de séquençage aient la plus grande portée et la plus grande utilité possible.
+Les données qui parviennent à l'ENA proviennent de différentes sources. Il s'agit notamment de '''données brutes, de séquences assemblées et d'annotations''' provenant d'efforts de séquençage à petite échelle, de données fournies par les principaux centres de séquençage européens et d'échanges réguliers et complets avec nos partenaires de l'International Nucleotide Sequence Database Collaboration (INSDC).
-Traduit avec DeepL.com (version gratuite)
+Dans le cadre de l'effort mondial visant à améliorer l'accès aux données de séquençage de nucléotides et leur utilisation, l'ENA collabore largement au '''développement de nos services et de nos technologies, ainsi qu'aux activités de normalisation'''.
 |Discipline=Vie & Santé
 |SousDisciplineVie&Sante=LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes
 |Thematique=Biologie moléculaire, Génomique
 |TypeDonnee=Séquences nucléotidiques, Données brutes, Annotations
+|Communaute=Communauté de recherche en sciences de la vie
+|Beneficiaire=Chercheurs, Enseignants-Chercheurs, Doctorants
+|ModeleEconomique=Gratuit
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 |Cgu=https://www.ebi.ac.uk/about/terms-of-use/
-|StatutPage=Page en construction
+|PorteeInternationale=ELIXIR; https://www.elixir-europe.org/,
+Global Core Biodata Resources; https://globalbiodata.org/what-we-do/global-core-biodata-resources/
 }}