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« ATLASea » : différence entre les versions
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|Description=Le '''programme de recherche exploratoire ATLASea''' vise à séquencer le génome de 4 500 espèces marines de la zone économique exclusive française. | |Description=Le '''programme de recherche exploratoire ATLASea''' vise à séquencer le génome de 4 500 espèces marines de la zone économique exclusive française. | ||
Il est structuré en trois Projets Ciblés (PC) qui récapitulent '''le flux de données, de l’océan vers une information digitalisée accessible à tous''' : | Il est structuré en trois Projets Ciblés (PC) qui récapitulent '''le flux de données, de l’océan vers une information digitalisée accessible à tous''' : | ||
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* '''SEQ-SEA''' qui concerne le '''séquençage des génomes'''. L’ADN sera extrait des '''échantillons au Genoscope, puis séquencé et assemblé en génomes de référence, et enfin annoté''' pour identifier la position des gènes. L’objectif est d’aboutir à des génomes de référence, c'est-à-dire complets. | * '''SEQ-SEA''' qui concerne le '''séquençage des génomes'''. L’ADN sera extrait des '''échantillons au Genoscope, puis séquencé et assemblé en génomes de référence, et enfin annoté''' pour identifier la position des gènes. L’objectif est d’aboutir à des génomes de référence, c'est-à-dire complets. | ||
* BYTE-SEA qui vise à '''établir l’infrastructure informatique requise pour gérer le flux de données depuis l’échantillonnage jusqu’au versement des données génomique dans le portail ATLASea'' et les dépôts internationaux. Il réalisera également des '''analyses à grande échelle''' pour retracer l’histoire évolutive des génomes et assigner des fonctions aux gènes. Les génomes seront finalement '''stockés dans des bases de données ouvertes et accessibles''' à la communauté internationale. | * '''BYTE-SEA''' qui vise à '''établir l’infrastructure informatique requise pour gérer le flux de données depuis l’échantillonnage jusqu’au versement des données génomique dans le portail ATLASea''' et les dépôts internationaux. Il réalisera également des '''analyses à grande échelle''' pour retracer l’histoire évolutive des génomes et assigner des fonctions aux gènes. Les génomes seront finalement '''stockés dans des bases de données ouvertes et accessibles''' à la communauté internationale. | ||