« POPS (IPS2) » : différence entre les versions
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(Page créée avec « {{Infobox Service |Logo=87 logoPF.png |NomService=IPS2 : POPS |TypeService=Plateforme de calcul |StatutService=En production |NomAlternatif=Plateforme transcriptOmique de l’iPS2 |UrlService=https://www.pluginlabs-universiteparissaclay.fr/fiche/ips2-plateforme-de-transcriptomique-pops/ |ContactMel=contact.ips2@u-psud.fr |Localisation=Gif-sur-Yvette |StructureAppartenance=IPS2 |Tutelle=Université Paris-Saclay |PhaseCycleVie=Collecte, Analyse |International=Non }... ») |
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{{Service | {{Service | ||
|Description=POPS est la plateforme de transcriptomique des plantes de Paris-Saclay localisée à l'institut de science des plantes Paris-Saclay (IPS2). Elle offre une expertise pour le développement de l’'''analyse du transcriptome chez les végétaux par l’utilisation du séquençage à haut débit d’ARN (RNA-Seq)'''. | |Description='''POPS''' est la plateforme de transcriptomique des plantes de Paris-Saclay localisée à l'institut de science des plantes Paris-Saclay (IPS2). Elle offre une expertise pour le développement de l’'''analyse du transcriptome chez les végétaux par l’utilisation du séquençage à haut débit d’ARN (RNA-Seq)'''. Leur savoir-faire s’étend de la préparation des échantillons à l’analyse bioinformatique et statistiques des données. | ||
Elle propose : | |||
1. Une expertise pour l’'''analyse de l’expression des gènes chez les plantes par l’utilisation du séquençage à haut-débit de l’ARN'''. Cette offre est complétée par l’'''analyse bioinformatique et statistique permettant l’analyse quantitative du transcriptome'''. | |||
2. Du développement méthodologique afin de répondre au mieux aux demandes de nos collaborateurs et d’élargir notre offre de service. | |||
3. Des formations et de l’animation scientifique | |||
|Discipline=Vie & Santé | |Discipline=Vie & Santé | ||
|SousDisciplineVie&Sante=LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes; LS8 Biologie environnementale, écologie et évolution | |SousDisciplineVie&Sante=LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes; LS8 Biologie environnementale, écologie et évolution | ||
|Thematique=Plateforme de bioinformatique, | |Thematique=Plateforme de bioinformatique, Organismes végétaux | ||
|TypeDonnee=Données génomiques | |TypeDonnee=Données génomiques, Données de séquençage | ||
|ConditionUsage=Pour soumettre un projet à la plateforme POPS, il est possible d'envoyer un mail à pops.ips2@universite-paris-saclay.fr en décrivant brièvement le projet. Après une première prise de contact permettant d’étudier la faisabilité du projet, une réunion téléphonique ou sur site sera proposée, afin de définir les objectifs et les questions biologiques, d’établir un plan d’expérience... Les collaborateurs et experts concernés de la plateforme seront présents à cette réunion. Le délai de réalisation des projets varie selon le type d’analyse, le nombre d’échantillons et le taux d’occupation de la plateforme. | |||
|Certification=ISO 9001:2015; | |Certification=ISO 9001:2015; | ||
IBiSA; https://www.ibisa.net/trouver-plateforme/ | IBiSA; https://www.ibisa.net/trouver-plateforme/ | ||