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« MGX » : différence entre les versions

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{{Service
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|Description=MGX-Montpellier GenomiX résulte de la mise en réseau des 4 plateaux de génomique de Montpellier :
|Description=MGX-Montpellier GenomiX propose les services suivants :


* Plateau MGX-NGS(IGF) : Séquençage très haut débit, biostatistiques et bioinformatique
* '''Séquençage haut débit'''
* MGX-Transcriptome (IRMB) : Puces à ADN Affymetrix
* '''Bio-statistiques et bio-informatique'''
* MGX-qPCR HD (DBS-B3ESTE) : PCR quantitative haut débit
* MGX-Génotypage (AGAP-ISEM) : Génotypage


MGX offre un interlocuteur unique pour les utilisateurs des plateaux de génomique montpelliérains et optimise la répartition du personnel et des moyens financiers.
Les applications incluent notamment '''le séquençage de novo ou le re-séquençage de génomes, l’étude du transcriptome de nombreuses espèces animales, végétales et procaryotes''', mais également les techniques d’étude de la structure et de la dynamique chromatinienne (ChIP-seq, 4C, Hi-C…) et des modifications épigénétiques (méthylation de l’ADN). Il développe des approches de génomique sur cellules uniques.
 
Elle offre également un '''service complet pour l’analyse des données issues du séquençage nouvelle génération''' : identification de gènes ou transcrits différentiellement exprimés, cytosines différentiellement méthylées, régions enrichies dans les données de ChIP-seq, variants statistiquement significatifs… Elle peut réaliser la contextualisation fonctionnelle des données.
 
La plateforme développe également des protocoles à façon pour répondre à des besoins spécifiques et participe à la formation de ses utilisateurs, tant pour la construction des banques que pour l’analyse des données
|Discipline=Vie & Santé
|Discipline=Vie & Santé
|SousDisciplineVie&Sante=LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes
|SousDisciplineVie&Sante=LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes
|Thematique=Plateforme de bioinformatique, NGS, Séquençage, Transcriptomique, RNA-Seq, Single cell RNA-Seq, small RNA-Seq, micro-ARN, Chromatine, ChIP-Seq, Epigénétique, Méthylation de l’ADN, Génotypage, Variants, PCR quantitative, PCR digitale, Statistiques
|TypeDonnee=Données génomiques, Données de séquençage
|Communaute=Communautés scientifiques académiques et médicales et laboratoires privés dans le domaine de la génomique.
|Beneficiaire=Chercheurs, Enseignants-Chercheurs, Médecins
|Certification=ISO 9001:2015; https://qualite.ibisa.net/certificats/certificat%20mgx%20fr.pdf,
|Certification=ISO 9001:2015; https://qualite.ibisa.net/certificats/certificat%20mgx%20fr.pdf,
IBiSA; https://www.ibisa.net/trouver-plateforme/,
IBiSA; https://www.ibisa.net/trouver-plateforme/,
NFX 50-900:2016; https://qualite.ibisa.net/certificats/certificat-mgx-nfx.pdf
NFX 50-900:2016; https://qualite.ibisa.net/certificats/certificat-mgx-nfx.pdf
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