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« PSI2BC » : différence entre les versions
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(Page créée avec « {{Infobox Service |Logo=399 logoPF.png |NomService=PSI2BC |TypeService=Plateforme de calcul |StatutService=En production |NomAlternatif=Plateforme de séquençage haut débit de l’I2BC |UrlService=https://www.i2bc.paris-saclay.fr/sequencing/ng-sequencing/ |ContactMel=I2BC-sequencage@i2bc.paris-saclay.fr |Localisation=Gif-sur-Yvette |StructureAppartenance=France Génomique, I2BC |Tutelle=CEA, CNRS, Université Paris-Saclay |PhaseCycleVie=Collecte, Analyse |Inter... ») |
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|Description=La '''plateforme PSI2B'''C est accessible à l’ensemble de la communauté scientifique, académique et industrielle. Elle prend en charge l’intégralité des prestations qui lui sont confiées, de la préparation des librairies et du séquençage à l’analyse primaire des données. | |Description=La '''plateforme PSI2B'''C est accessible à l’ensemble de la communauté scientifique, académique et industrielle. Elle prend en charge l’intégralité des prestations qui lui sont confiées, de la préparation des librairies et du séquençage à l’analyse primaire des données. | ||
La plateforme propose à ses utilisateurs une large gamme de techniques pour la préparation de banques d’ADN ou d’ARN et pour leur séquençage avec la technologie Illumina ou Oxford Nanopore Technologies (ONT). Elle mène également des analyses bioinformatiques diverses (cartographie, expression différentielle des gènes...) définies en accord avec les utilisateurs en début de projet. Pour les projets complexes, des analyses bioinformatiques plus poussées peuvent être réalisées dans le cadre de collaborations. | La plateforme propose à ses utilisateurs une '''large gamme de techniques pour la préparation de banques d’ADN ou d’ARN et pour leur séquençage avec la technologie Illumina ou Oxford Nanopore Technologies''' (ONT). Elle mène également des '''analyses bioinformatiques diverses''' (cartographie, expression différentielle des gènes...) définies en accord avec les utilisateurs en début de projet. Pour les projets complexes, des analyses bioinformatiques plus poussées peuvent être réalisées dans le cadre de collaborations. | ||
|Discipline=Vie & Santé | |Discipline=Vie & Santé | ||
|Thematique=Plateforme de bioinformatique | |||
|TypeDonnee=Données génomiques, Données de séquençage | |||
|Communaute=Communauté scientifique, académique et industrielle | |Communaute=Communauté scientifique, académique et industrielle | ||
|Beneficiaire=Chercheurs, Enseignants | |Beneficiaire=Chercheurs, Enseignants-Chercheurs, Doctorants, Industriels | ||
|ConditionUsage=Pour soumettre un projet à PSI2BC, il est nécessaire de contacter la plateforme par téléphone ou par mail à l'adresse i2bc-sequencage@i2bc.paris-saclay.fr en expliquant aussi clairement que possible le projet de séquençage. La plateforme déterminera alors si elle est en mesure de prendre en charge le projet. Une réunion sera organisée pour préciser certains détails, analyser le projet ou planifier la réalisation des expériences. La prestation démarrera après réception du devis signé et des échantillons correctement annotés selon la fiche. | |ConditionUsage=Pour soumettre un projet à PSI2BC, il est nécessaire de contacter la plateforme par téléphone ou par mail à l'adresse i2bc-sequencage@i2bc.paris-saclay.fr en expliquant aussi clairement que possible le projet de séquençage. La plateforme déterminera alors si elle est en mesure de prendre en charge le projet. Une réunion sera organisée pour préciser certains détails, analyser le projet ou planifier la réalisation des expériences. La prestation démarrera après réception du devis signé et des échantillons correctement annotés selon la fiche. | ||
|ModeleEconomique=Après validation de la faisabilité du projet, la platforme enverra un devis. | |ModeleEconomique=Après validation de la faisabilité du projet, la platforme enverra un devis. | ||