]> 2026-04-26T17:50:01+02:00 TGML 0 fr Communautés de la recherche publique française et internationale, industrielle 43.24103,5.43851 La plateforme '''TGML''' propose son expertise pour l'analyse de différents types de projets liés au '''séquençage à haut débit'''. Elle offre une large palette d’outils expérimentaux et bioinformatiques pour l’étude du '''transcriptome et de la génomique fonctionnelle'''. Ses ingénieurs assurent le traitement et l’analyse de puces à ADN, la construction de librairies, le séquençage et les analyses de données (primaires et secondaires). Les services proposés sont : * '''Biologie moléculaire''' # Transcriptomique : RNA-seq sur cellule unique (avec ou sans cell hashing), mRNA-seq en masse (polyA, total) et puces à ADN (DGE, miRNA, CGH) # Génomique : Re-séquençage ciblé, exome complet, SNV, petits / grands IndDels # Épigénomique : ChIP-seq, FAIRE-seq / ATAC-seq, MNnase-seq, 3C-seq, 4C-seq * '''Bioinformatique''' : # Metaworkflow : Flux de travail de routine pour le traitement des données selon le principe FAIR (Findable, Accessible, Interoperable and Reusable) pour la génération de données # OLOGRAM (OverLap Of Genomic Regions Analysis using Monte Carlo) : réalise des statistiques de chevauchement entre des ensembles de régions génomiques décrites dans des BED ou des GTF # PyGTFtk (Python GTF tool kit) : un paquetage Python destiné à faciliter la manipulation des fichiers GTF/GFF2.0 (Gene Transfer Format) denis.puthier@univ-amu.fr beatrice.loriod@inserm.fr TGML Transcriptomique et génomique Marseille Luminy, TAGC-BU TAGC-BU Transcriptomique et génomique Marseille Luminy En production Plateforme de bioinformatique Génomique Biostatistique Logiciel Séquençage Analyse à grande échelle true false 2023-11-14T15:04:20Z 2460263.1280093 2025-07-18T09:52:26Z 2460874.911412 TGML 0 ISO 9001:2015 TGML#ISO 9001:2015;https://qualite.ibisa.net/certificats/tgml-iso-9001.pdf 0 NFX 50-900:2016 TGML#NFX 50-900:2016;https://qualite.ibisa.net/certificats/tgml-nfx.pdf 0 IBiSA TGML#IBiSA;http://www.ibisa.net/plateformes/ 0 0 leaflet 1 [[:TGML]] TGML# QUERY0aab0118e6d7a47b179efab811e53deb 0 1 broadtable 2 [[-A pour structure::TGML]] TGML# QUERY4b1fb0b2642d6595aa18d5a86c32e79d TAGC-BU 0 fr TAGC-BU REDI 102 fr REDI