]> 2026-04-26T19:05:29+02:00 PPanGGOLiN 0 fr Chercheurs, Enseignants-chercheurs, Doctorants, Ingénieurs, Techniciens Communauté scientifique en génomique Le code source, en langage python, est disponible sur GitHub : https://ppanggolin.readthedocs.io/en/latest/user/install.html#installing-from-source-code-github 48.62399,2.43972 '''PPanGGOLiN''' est un logiciel de bioinformatique dédié à l'analyse de pangénomes developpé par le [https://labgem.genoscope.cns.fr/ LABGeM]. Il permet de '''créer, manipuler et analyser des pangénomes procaryotes''' en utilisant des dizaines voire des milliers de génomes d'une même espèce. Il permet ainsi d'étudier l'évolution ou l'écologie des microbes, ouvrant la voie à des découvertes importantes pour la santé humaine, l'agriculture, l'alimentation ou l'environnement. Le laboratoire LABGeM a également intégré l'outil dans sa plateforme de service, [[MicroScope]], mis à disposition des microbiologistes et qui comprend plus de 6600 utilisateurs à travers le monde. Une nouvelle version (2.0) du logiciel a été déployée en janvier 2024 avec de nouvelles fonctionnalités incluant la possibilité d''''associer des métadonnées aux pangénomes , une structure de données améliorée pour le stockage des pangénomes, et une toute nouvelle documentation'''. Evry acalteau@genoscope.cns.fr Gratuit PPanGGOLiN Depicting microbial species diversity via a Partitioned PanGenome Graph Of Linked Neighbors Depicting microbial species diversity via a Partitioned PanGenome Graph Of Linked Neighbors En production Logiciel Pangénomique Génomique comparative logiciel true false 2024-04-03T07:10:28Z 2460403.7989352 2025-04-28T13:02:54Z 2460794.0436806 PPanGGOLiN 0 0 leaflet 1 [[:PPanGGOLiN]] PPanGGOLiN# QUERY0b6301c1bb3deafd871351bc095ee32a 0 1 broadtable 2 [[-A pour structure::PPanGGOLiN]] PPanGGOLiN# QUERY577375c26abe6b791a9f17327f77bb61 MicroScope 0 fr MicroScope A pour relation 102 fr A pour relation