]> 2026-04-20T05:43:26+02:00 AuBI 0 fr Chercheurs, Enseignants-Chercheurs, Doctorants Unités de recherche de l'Université Clermont Auvergne 45.76269,3.10921 La '''plateforme Auvergne BioInformatique''', AuBI, rassemble les ressources bioinformatiques du site auvergnat, et s'appuie sur les ressources en calcul et en stockage du Mésocentre Clermont-Auvergne pour promouvoir '''l'accès aux installations informatiques pour l'analyse des données, le stockage, la formation en bio-informatique et l'hébergement de services web pour la recherche'''. Des compétences importantes sont développées pour soutenir des projets scientifiques dans le domaine de l'analyse de séquences à grande échelle en génomique (assemblage, annotation, analyse de variantes, DNAseq, ...), transcriptomique (RNAseq, ChiPseq, ...) et variations épigénomiques (BSseq), métagénomique, métatranscriptomique, métabolomique, dynamique moléculaire mais aussi statistique et imagerie. Elle est associée à l'[https://www.france-bioinformatique.fr/ Institut Français de Bioinformatique] ainsi qu'à la [https://www.france-genomique.org/ plateforme France Génomique] . Le Mésocentre Clermont-Auvergne fournit un accès à des banques de données biologiques publiques. Leurs mises à jours sont gérées par [https://biomaj.genouest.org/ BioMAJ]. Les données brutes proviennent de sites distants (NCBI, flybase, ensembl, ...) et sont indexées automatiquement en local pour être utilisées ensuite par les différents outils sur le cluster de calcul HPC2 ou via le serveur web Galaxy. La liste des banques de données disponibles et les informations afférentes sont accessibles grâce à l'interface [https://biodatabanks.mesocentre.uca.fr/app/#/bank/ Biomaj Watcher]. Deux services web sont proposés au sein d'AuBI : * '''Galaxy''', pour y conduire des analyses de transcriptomique, génomique, métagénomique * '''[[OMERO]]''', pour le stockage d'images et des métadonnées associées Clermont-Ferrand support.dsi@uca.fr aubi@uca.fr Gratuit pour les usagers UCA & associés AuBI Auvergne BioInformatique Auvergne BioInformatique esr national En production Plateforme de bioinformatique Biologie fondamentale Microbiologie Agronomie Environnement Santé Epidémiologie true false 2020-07-24T08:16:43Z 2459054.8449421 2026-03-10T10:49:17Z 2461109.9508912 AuBI 0 HAL AuBI#https://aurehal.archives-ouvertes.fr/structure/read/id/1076817;HAL 0 DOI AuBI#https://doi.org/10.18145/AuBI;DOI 0 0 leaflet 1 [[:AuBI]] AuBI# QUERY19554bcabf7896c309c3adf35fcddba2 0 1 broadtable 2 [[-A pour structure::AuBI]] AuBI# QUERY93bb42551de29ea06d811f3784968d7b France Génomique 0 fr France Génomique OMERO 0 fr OMERO A pour relation 102 fr A pour relation A pour structure 102 fr A pour structure