]> 2026-04-26T22:03:10+02:00 ATGC 0 fr Chercheurs (public et privé) Communautés scientifiques de recherche en biologie publiques et privées Les outils sont accessibles en ligne gratuitement. Ils peuvent être téléchargés et/ou exécutés sur les clusters du LIRMM. Pour mettre en place un projet, il faut contacter l'équipe à l'adresse suivante : atgc-hts@lirmm.fr. 43.63687,3.84071 '''ATGC, plateforme de bioinformatique de Montpellier''' fournit des services de génomique évolutive, comparative et fonctionnelle. Elle met en avant les développements méthodologiques réalisés par l'équipe Méthodes et Algorithmes pour la Bioinformatique (MAB) du LIRMM. Ces développements sont diffusés à la communauté scientifique sous forme de services en libre accès sur le site web de la plateforme. La plupart des outils peuvent être utilisés directement en ligne, via une interface web dédiée à partir de laquelle chaque utilisateur peut charger ses propres données. Ces interfaces ont été conçues pour faciliter la présentation des outils, l'analyse et l'interprétation des résultats. Expertise : *'''Analyse qualitative du transcriptome par RNA-seq ou Digital Gene Expression''' (SAGE) *'''Assemblage de transcriptome de novo''' (RNA-seq) *'''Correction hybride de reads PacBio (Pacific BioSciences) pour DNA-seq ou RNA-seq''' *'''Analyse génomique''' : recherche de mutations, insertion délétions, réarrangements *'''Mapping de reads génomiques ou transcriptomiques''' Plateforme CNRS Sciences informatiques qui est un site d'implantation de l'Institut Francais de Bioinformatique Montpellier vincent.lefort@lirmm.fr atgc-hts@lirmm.fr ATGC Plateforme de bio-informatique de Montpellier, ATGC BioInformatique ATGC BioInformatique Plateforme de bio-informatique de Montpellier esr thematique public prive national international En production Plateforme de bioinformatique Données génomiques Plateforme CNRS Sciences informatiques qui est un site d'implantation de l'Institut Francais de Bioinformatique true false 2020-08-27T09:29:24Z 2459088.8954167 2026-03-16T13:24:30Z 2461116.0586806 ATGC 0 IBiSA ATGC#IBiSA;http://www.ibisa.net/plateformes/ 0 ELIXIR ATGC#ELIXIR;https://elixir-europe.org/ 0 0 leaflet 1 [[:ATGC]] ATGC# QUERY528d3cb37c62b02c14b7a5dda5daaacc 0 1 broadtable 2 [[-A pour structure::ATGC]] ATGC# QUERY45885dd929637f9f7b2c1831147b7527 Bio2M 0 fr Bio2M France Génomique 0 fr France Génomique A pour relation 102 fr A pour relation