LoRDEC - Historique des versions

SidonieRaffy le 28 avril 2025 à 08:45

2025-04-28T08:45:11Z

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	\|TypeService=Outils de gestion des données		\|TypeService=Outils de gestion des données
	\|StatutService=En production		\|StatutService=En production
			\|NomDéveloppé=LoRDEC: hybrid Correction of Long Reads
	\|NomAlternatif=LoRDEC: hybrid Correction of Long Reads		\|NomAlternatif=LoRDEC: hybrid Correction of Long Reads
	\|UrlService=http://www.atgc-montpellier.fr/lordec/ , ~~http~~://www.lirmm.fr/~rivals/lordec/		\|UrlService=http://www.atgc-montpellier.fr/lordec/, https://www.lirmm.fr/~rivals/lordec/
	\|ContactMel=Eric.Rivals@lirmm.fr		\|ContactMel=Eric.Rivals@lirmm.fr
	\|Localisation=Montpellier		\|Localisation=Montpellier
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	\|Tutelle=CNRS		\|Tutelle=CNRS
	\|PhaseCycleVie=Analyse, Documentation		\|PhaseCycleVie=Analyse, Documentation
			\|International=Non
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	{{Coordonnées GPS		{{Coordonnées GPS
	\|CoordonneeGeographique=43.63687, 3.84071		\|CoordonneeGeographique=43.63687, 3.84071
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	~~[[Aide à la gestion:: logiciel\| ]]~~
	{{Service		{{Service
	\|Description=Le logiciel de bioinformatique LoRDEC renferme des algorithmes performants pour analyser les séquences biologiques à grande échelle, il permet la correction d'erreur pour les séquenceurs de troisième génération. Logiciel autonome pour la correction d'erreurs de longues lectures (de Pacific Biosciences, ou Oxford Nanopore) avec une approche hybride. LoRDEC utilise des lectures courtes pour corriger des lectures longues ; il combine des données de séquençage provenant des technologies de deuxième et troisième générations. Il peut être facilement intégré dans n'importe quel pipeline pour traiter des données de séquençage profond. L'originalité de LoRDEC est de construire un graphe qui résume toutes les lectures courtes, puis d'aligner les lectures longues sur ce graphe pour les corriger. Cela fait du LoRDEC un outil très efficace pour traiter de grands ensembles de données.		\|Description=Le logiciel de bioinformatique LoRDEC renferme des algorithmes performants pour analyser les séquences biologiques à grande échelle, il permet la correction d'erreur pour les séquenceurs de troisième génération. Logiciel autonome pour la correction d'erreurs de longues lectures (de Pacific Biosciences, ou Oxford Nanopore) avec une approche hybride. LoRDEC utilise des lectures courtes pour corriger des lectures longues ; il combine des données de séquençage provenant des technologies de deuxième et troisième générations. Il peut être facilement intégré dans n'importe quel pipeline pour traiter des données de séquençage profond. L'originalité de LoRDEC est de construire un graphe qui résume toutes les lectures courtes, puis d'aligner les lectures longues sur ce graphe pour les corriger. Cela fait du LoRDEC un outil très efficace pour traiter de grands ensembles de données.
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	\|PorteeInternationale=ELIXIR;https://elixir-europe.org/		\|PorteeInternationale=ELIXIR;https://elixir-europe.org/
	}}		}}
			[[Aide à la gestion:: logiciel\| ]]

AnneAdmin le 7 novembre 2023 à 14:23

2023-11-07T14:23:21Z

← Version précédente		Version du 7 novembre 2023 à 16:23
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	\|SousDisciplineVie&Sante=LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes		\|SousDisciplineVie&Sante=LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes
	\|Thematique=Bioinformatique, Outil d'analyse, Analyse de données de séquençage NGS,Méthodologie,Alignements de lectures sur des génomes		\|Thematique=Bioinformatique, Outil d'analyse, Analyse de données de séquençage NGS,Méthodologie,Alignements de lectures sur des génomes
	\|Relation=IFB, CNRS~~-INS2I~~		\|Relation=IFB, CNRS Sciences informatiques
	\|PorteeInternationale=ELIXIR;https://elixir-europe.org/		\|PorteeInternationale=ELIXIR;https://elixir-europe.org/
	}}		}}

AnneAdmin : Remplacement de texte : « |CoordonneeGeographique= » par « }} {{Coordonnées GPS |CoordonneeGeographique= »

2023-07-06T12:09:48Z

Remplacement de texte : « |CoordonneeGeographique= » par « }} {{Coordonnées GPS |CoordonneeGeographique= »

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	\|Tutelle=CNRS		\|Tutelle=CNRS
	\|PhaseCycleVie=Analyse, Documentation		\|PhaseCycleVie=Analyse, Documentation
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			{{Coordonnées GPS
	\|CoordonneeGeographique=43.63687, 3.84071		\|CoordonneeGeographique=43.63687, 3.84071
	}}		}}

Warth le 15 mars 2023 à 08:16

2023-03-15T08:16:31Z

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	\|CoordonneeGeographique=43.63687, 3.84071		\|CoordonneeGeographique=43.63687, 3.84071
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	[[Aide à la gestion::logiciel]]		[[Aide à la gestion:: logiciel\| ]]
	{{Service		{{Service
	\|Description=Le logiciel de bioinformatique LoRDEC renferme des algorithmes performants pour analyser les séquences biologiques à grande échelle, il permet la correction d'erreur pour les séquenceurs de troisième génération. Logiciel autonome pour la correction d'erreurs de longues lectures (de Pacific Biosciences, ou Oxford Nanopore) avec une approche hybride. LoRDEC utilise des lectures courtes pour corriger des lectures longues ; il combine des données de séquençage provenant des technologies de deuxième et troisième générations. Il peut être facilement intégré dans n'importe quel pipeline pour traiter des données de séquençage profond. L'originalité de LoRDEC est de construire un graphe qui résume toutes les lectures courtes, puis d'aligner les lectures longues sur ce graphe pour les corriger. Cela fait du LoRDEC un outil très efficace pour traiter de grands ensembles de données.		\|Description=Le logiciel de bioinformatique LoRDEC renferme des algorithmes performants pour analyser les séquences biologiques à grande échelle, il permet la correction d'erreur pour les séquenceurs de troisième génération. Logiciel autonome pour la correction d'erreurs de longues lectures (de Pacific Biosciences, ou Oxford Nanopore) avec une approche hybride. LoRDEC utilise des lectures courtes pour corriger des lectures longues ; il combine des données de séquençage provenant des technologies de deuxième et troisième générations. Il peut être facilement intégré dans n'importe quel pipeline pour traiter des données de séquençage profond. L'originalité de LoRDEC est de construire un graphe qui résume toutes les lectures courtes, puis d'aligner les lectures longues sur ce graphe pour les corriger. Cela fait du LoRDEC un outil très efficace pour traiter de grands ensembles de données.

Warth le 14 mars 2023 à 16:23

2023-03-14T16:23:10Z

← Version précédente		Version du 14 mars 2023 à 18:23
Ligne 12 :		Ligne 12 :
	\|CoordonneeGeographique=43.63687, 3.84071		\|CoordonneeGeographique=43.63687, 3.84071
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			[[Aide à la gestion::logiciel]]
	{{Service		{{Service
	\|Description=Le logiciel de bioinformatique LoRDEC renferme des algorithmes performants pour analyser les séquences biologiques à grande échelle, il permet la correction d'erreur pour les séquenceurs de troisième génération. Logiciel autonome pour la correction d'erreurs de longues lectures (de Pacific Biosciences, ou Oxford Nanopore) avec une approche hybride. LoRDEC utilise des lectures courtes pour corriger des lectures longues ; il combine des données de séquençage provenant des technologies de deuxième et troisième générations. Il peut être facilement intégré dans n'importe quel pipeline pour traiter des données de séquençage profond. L'originalité de LoRDEC est de construire un graphe qui résume toutes les lectures courtes, puis d'aligner les lectures longues sur ce graphe pour les corriger. Cela fait du LoRDEC un outil très efficace pour traiter de grands ensembles de données.		\|Description=Le logiciel de bioinformatique LoRDEC renferme des algorithmes performants pour analyser les séquences biologiques à grande échelle, il permet la correction d'erreur pour les séquenceurs de troisième génération. Logiciel autonome pour la correction d'erreurs de longues lectures (de Pacific Biosciences, ou Oxford Nanopore) avec une approche hybride. LoRDEC utilise des lectures courtes pour corriger des lectures longues ; il combine des données de séquençage provenant des technologies de deuxième et troisième générations. Il peut être facilement intégré dans n'importe quel pipeline pour traiter des données de séquençage profond. L'originalité de LoRDEC est de construire un graphe qui résume toutes les lectures courtes, puis d'aligner les lectures longues sur ce graphe pour les corriger. Cela fait du LoRDEC un outil très efficace pour traiter de grands ensembles de données.

AnneAdmin : Remplacement de texte — « Génétique, "omiques", bioinformatique et biologie des systèmes » par « LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes »

2022-03-11T12:22:53Z

Remplacement de texte — « Génétique, "omiques", bioinformatique et biologie des systèmes » par « LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes »

← Version précédente		Version du 11 mars 2022 à 14:22
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	\|Description=Le logiciel de bioinformatique LoRDEC renferme des algorithmes performants pour analyser les séquences biologiques à grande échelle, il permet la correction d'erreur pour les séquenceurs de troisième génération. Logiciel autonome pour la correction d'erreurs de longues lectures (de Pacific Biosciences, ou Oxford Nanopore) avec une approche hybride. LoRDEC utilise des lectures courtes pour corriger des lectures longues ; il combine des données de séquençage provenant des technologies de deuxième et troisième générations. Il peut être facilement intégré dans n'importe quel pipeline pour traiter des données de séquençage profond. L'originalité de LoRDEC est de construire un graphe qui résume toutes les lectures courtes, puis d'aligner les lectures longues sur ce graphe pour les corriger. Cela fait du LoRDEC un outil très efficace pour traiter de grands ensembles de données.		\|Description=Le logiciel de bioinformatique LoRDEC renferme des algorithmes performants pour analyser les séquences biologiques à grande échelle, il permet la correction d'erreur pour les séquenceurs de troisième génération. Logiciel autonome pour la correction d'erreurs de longues lectures (de Pacific Biosciences, ou Oxford Nanopore) avec une approche hybride. LoRDEC utilise des lectures courtes pour corriger des lectures longues ; il combine des données de séquençage provenant des technologies de deuxième et troisième générations. Il peut être facilement intégré dans n'importe quel pipeline pour traiter des données de séquençage profond. L'originalité de LoRDEC est de construire un graphe qui résume toutes les lectures courtes, puis d'aligner les lectures longues sur ce graphe pour les corriger. Cela fait du LoRDEC un outil très efficace pour traiter de grands ensembles de données.
	\|Discipline=Vie & Santé		\|Discipline=Vie & Santé
	\|SousDisciplineVie&Sante=~~Génétique, "omiques", bioinformatique~~ et ~~biologie~~ des systèmes		\|SousDisciplineVie&Sante=LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes
	\|Thematique=Bioinformatique, Outil d'analyse, Analyse de données de séquençage NGS,Méthodologie,Alignements de lectures sur des génomes		\|Thematique=Bioinformatique, Outil d'analyse, Analyse de données de séquençage NGS,Méthodologie,Alignements de lectures sur des génomes
	\|Relation=IFB, CNRS-INS2I		\|Relation=IFB, CNRS-INS2I
	\|PorteeInternationale=ELIXIR;https://elixir-europe.org/		\|PorteeInternationale=ELIXIR;https://elixir-europe.org/
	}}		}}

AnneAdmin le 29 novembre 2021 à 13:20

2021-11-29T13:20:08Z

← Version précédente		Version du 29 novembre 2021 à 15:20
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	{{Infobox Service		{{Infobox Service
	~~\|Logo=~~
	\|NomService=LoRDEC		\|NomService=LoRDEC
	\|TypeService=Outils de gestion des données		\|TypeService=Outils de gestion des données
Ligne 9 :		Ligne 8 :
	\|Localisation=Montpellier		\|Localisation=Montpellier
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Ligne 22 :		Ligne 17 :
	\|SousDisciplineVie&Sante=Génétique, "omiques", bioinformatique et biologie des systèmes		\|SousDisciplineVie&Sante=Génétique, "omiques", bioinformatique et biologie des systèmes
	\|Thematique=Bioinformatique, Outil d'analyse, Analyse de données de séquençage NGS,Méthodologie,Alignements de lectures sur des génomes		\|Thematique=Bioinformatique, Outil d'analyse, Analyse de données de séquençage NGS,Méthodologie,Alignements de lectures sur des génomes
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	\|Relation=IFB
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	}}		}}

AnneAdmin le 22 novembre 2021 à 13:56

2021-11-22T13:56:43Z

← Version précédente		Version du 22 novembre 2021 à 15:56
Ligne 33 :		Ligne 33 :
	\|PorteeInternationale=ELIXIR;https://elixir-europe.org/		\|PorteeInternationale=ELIXIR;https://elixir-europe.org/
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	~~[[Catégorie:Annuaire CNRS]] [[Catégorie:Annuaire CNRS-INSB]]~~

AnneAdmin le 18 juin 2021 à 07:43

2021-06-18T07:43:52Z

← Version précédente		Version du 18 juin 2021 à 09:43
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	{{Service		{{Service
	\|Description=Le logiciel de bioinformatique LoRDEC renferme des algorithmes performants pour analyser les séquences biologiques à grande échelle, il permet la correction d'erreur pour les séquenceurs de troisième génération.		\|Description=Le logiciel de bioinformatique LoRDEC renferme des algorithmes performants pour analyser les séquences biologiques à grande échelle, il permet la correction d'erreur pour les séquenceurs de troisième génération. Logiciel autonome pour la correction d'erreurs de longues lectures (de Pacific Biosciences, ou Oxford Nanopore) avec une approche hybride. LoRDEC utilise des lectures courtes pour corriger des lectures longues ; il combine des données de séquençage provenant des technologies de deuxième et troisième générations. Il peut être facilement intégré dans n'importe quel pipeline pour traiter des données de séquençage profond. L'originalité de LoRDEC est de construire un graphe qui résume toutes les lectures courtes, puis d'aligner les lectures longues sur ce graphe pour les corriger. Cela fait du LoRDEC un outil très efficace pour traiter de grands ensembles de données.
	\|Discipline=Vie & Santé		\|Discipline=Vie & Santé
	\|SousDisciplineVie&Sante=Génétique, "omiques", bioinformatique et biologie des systèmes		\|SousDisciplineVie&Sante=Génétique, "omiques", bioinformatique et biologie des systèmes
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	\|Communaute=		\|Communaute=
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AnneAdmin le 27 janvier 2021 à 10:26

2021-01-27T10:26:38Z

← Version précédente		Version du 27 janvier 2021 à 12:26
Ligne 11 :		Ligne 11 :
	\|Tutelle=CNRS-INS2I		\|Tutelle=CNRS-INS2I
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	\|IdentifiantAlternatif=		\|IdentifiantAlternatif=
	\|PhaseCycleVie=Analyse, Documentation		\|PhaseCycleVie=Analyse, Documentation
Ligne 18 :		Ligne 20 :
	\|Description=Le logiciel de bioinformatique LoRDEC renferme des algorithmes performants pour analyser les séquences biologiques à grande échelle, il permet la correction d'erreur pour les séquenceurs de troisième génération.		\|Description=Le logiciel de bioinformatique LoRDEC renferme des algorithmes performants pour analyser les séquences biologiques à grande échelle, il permet la correction d'erreur pour les séquenceurs de troisième génération.
	\|Discipline=Vie & Santé		\|Discipline=Vie & Santé
			\|SousDisciplineVie&Sante=Génétique, "omiques", bioinformatique et biologie des systèmes
	\|Thematique=Bioinformatique, Outil d'analyse, Analyse de données de séquençage NGS,Méthodologie,Alignements de lectures sur des génomes		\|Thematique=Bioinformatique, Outil d'analyse, Analyse de données de séquençage NGS,Méthodologie,Alignements de lectures sur des génomes
	\|TypeDonnee=		\|TypeDonnee=