Genoscope - Historique des versions

IsabelleCao le 30 mars 2026 à 13:29

2026-03-30T13:29:31Z

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	\|Thematique=Plateforme de bioinformatique, Biodiversité		\|Thematique=Plateforme de bioinformatique, Biodiversité
	\|TypeDonnee=Données génomiques, Données de séquençage		\|TypeDonnee=Données génomiques, Données de séquençage
	\|~~Communaute~~=~~Communautés scientifiques académiques~~		\|PerimetreCommunaute=ESR, national
	\|Beneficiaire=Chercheurs, Enseignants-Chercheurs, Médecins		\|Beneficiaire=Chercheurs, Enseignants-Chercheurs, Médecins
	\|ConditionUsage=Les soumissions de projets s’effectue via le site de France Génomique		\|ConditionUsage=Les soumissions de projets s’effectue via le site de France Génomique

IsabelleCao le 8 décembre 2025 à 14:43

2025-12-08T14:43:11Z

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	\|NomDéveloppé=Centre National de Séquençage		\|NomDéveloppé=Centre National de Séquençage
	\|NomAlternatifRéduit=Plateforme de séquençage du Genoscope		\|NomAlternatifRéduit=Plateforme de séquençage du Genoscope
	\|~~NomAlternatif=Centre National de Séquençage, Plateforme de séquençage du Genoscope~~		\|UrlStructure=https://jacob.cea.fr/drf/ifrancoisjacob/Pages/Departements/Genoscope.aspx
	~~\|Url~~=https://jacob.cea.fr/drf/ifrancoisjacob/Pages/Departements/Genoscope.aspx
	\|Tutelle=CEA		\|Tutelle=CEA
	\|IDRNSR=201722556Y		\|IDRNSR=201722556Y
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	\|TypeService=Plateforme de calcul		\|TypeService=Plateforme de calcul
	\|StatutService=En production		\|StatutService=En production
			\|UrlService=https://jacob.cea.fr/drf/ifrancoisjacob/Pages/Departements/Genoscope.aspx
	\|ContactMel=pcoutool@genoscope.cns.fr		\|ContactMel=pcoutool@genoscope.cns.fr
	\|StructureAppartenance=Genoscope		\|StructureAppartenance=Genoscope
	\|PhaseCycleVie=Collecte, Analyse		\|PhaseCycleVie=Collecte, Analyse
			\|NomAlternatif=Centre National de Séquençage, Plateforme de séquençage du Genoscope
			\|Url=https://jacob.cea.fr/drf/ifrancoisjacob/Pages/Departements/Genoscope.aspx
	\|NomStructure=Genoscope		\|NomStructure=Genoscope
	\|Description=Après avoir été l’un des acteurs du projet génome humain, le '''Centre National de Séquençage''' ('''Genoscope''') a mis le cap vers '''la génomique environnementale'''. L’exploitation des données de séquences, prolongée par l’identification expérimentale des fonctions biologiques, notamment dans le domaine de '''la biocatalyse''', ouvrent des perspectives de développements en '''biotechnologie industrielle'''. C’est dans une logique de développement durable que le Genoscope cherche '''des solutions biologiques dans la chimie de synthèse''', afin de la rendre moins polluante et moins consommatrice d’énergie et de carbone fossile.		\|Description=Après avoir été l’un des acteurs du projet génome humain, le '''Centre National de Séquençage''' ('''Genoscope''') a mis le cap vers '''la génomique environnementale'''. L’exploitation des données de séquences, prolongée par l’identification expérimentale des fonctions biologiques, notamment dans le domaine de '''la biocatalyse''', ouvrent des perspectives de développements en '''biotechnologie industrielle'''. C’est dans une logique de développement durable que le Genoscope cherche '''des solutions biologiques dans la chimie de synthèse''', afin de la rendre moins polluante et moins consommatrice d’énergie et de carbone fossile.

IsabelleCao le 16 mai 2025 à 13:57

2025-05-16T13:57:55Z

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	{{InfoboxStructureService		{{InfoboxStructureService
	\|Logo=Logo Genoscope ORIG 344.gif		\|Logo=Logo Genoscope ORIG 344.gif
			\|Nom=Genoscope
	\|NomDéveloppé=Centre National de Séquençage		\|NomDéveloppé=Centre National de Séquençage
	\|NomAlternatifRéduit=Plateforme de séquençage du Genoscope		\|NomAlternatifRéduit=Plateforme de séquençage du Genoscope

SidonieRaffy le 14 avril 2025 à 16:20

2025-04-14T16:20:49Z

← Version précédente		Version du 14 avril 2025 à 18:20
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	{{InfoboxStructureService		{{InfoboxStructureService
	\|Logo=Logo Genoscope ORIG 344.gif		\|Logo=Logo Genoscope ORIG 344.gif
			\|NomDéveloppé=Centre National de Séquençage
			\|NomAlternatifRéduit=Plateforme de séquençage du Genoscope
	\|NomAlternatif=Centre National de Séquençage, Plateforme de séquençage du Genoscope		\|NomAlternatif=Centre National de Séquençage, Plateforme de séquençage du Genoscope
	\|Url=https://jacob.cea.fr/drf/ifrancoisjacob/Pages/Departements/Genoscope.aspx		\|Url=https://jacob.cea.fr/drf/ifrancoisjacob/Pages/Departements/Genoscope.aspx

SidonieRaffy le 13 décembre 2024 à 09:11

2024-12-13T09:11:44Z

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	}}		}}
	{{ServiceStructure		{{ServiceStructure
	\|Description=L'équipe du '''~~laboratoire~~ de séquençage du Genoscope''' s'implique dans la prise en main des projets à partir de la réception des échantillons jusqu'à la validation des séquences brutes.		\|Description=L'équipe de la '''plateforme nationale de séquençage du Genoscope''' s'implique dans la prise en main des projets à partir de la réception des échantillons jusqu'à la validation des séquences brutes.

	Il s’est orienté vers l’étude de la biodiversité, à travers le séquençage de novo de grands génomes complets, de metagénomes complexes et plus généralement de collections d’ADN nécessitant une approche de séquençage à très grande échelle.		Il s’est orienté vers l’étude de la biodiversité, à travers le séquençage de novo de grands génomes complets, de metagénomes complexes et plus généralement de collections d’ADN nécessitant une approche de séquençage à très grande échelle.

SidonieRaffy le 13 décembre 2024 à 09:10

2024-12-13T09:10:23Z

← Version précédente		Version du 13 décembre 2024 à 11:10
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	}}		}}
	{{ServiceStructure		{{ServiceStructure
	\|Description=L'équipe du '''laboratoire de séquençage du Genoscope''' s'implique dans la prise en main des projets à partir de la réception des échantillons jusqu'à la validation des séquences brutes. Le séquençage est assuré par des séquenceurs très haut débit de deuxième génération. Ces machines permettent d'atteindre un débit autorisant le séquençage de génomes entiers dans un intervalle de temps limité.		\|Description=L'équipe du '''laboratoire de séquençage du Genoscope''' s'implique dans la prise en main des projets à partir de la réception des échantillons jusqu'à la validation des séquences brutes.

			Il s’est orienté vers l’étude de la biodiversité, à travers le séquençage de novo de grands génomes complets, de metagénomes complexes et plus généralement de collections d’ADN nécessitant une approche de séquençage à très grande échelle.

	~~Les projets actuellement développés concernent un large panel d~~'~~organismes, par exemple :~~		Une équipe de chercheurs se consacre aussi au '''développement et optimisation de nouvelles stratégies de séquençage''', y compris l’essai et valorisation des données issus de séquenceurs de troisième génération : lectures ultra longues, modifications épigénétiques, stratégies read-until, etc.
	* Reséquençage : champignon unicellulaire comme la levure (Saccharomyces cerevisiae) ou organisme végétal comme le riz (genre Oryza),
	* Séquençage de ~~novo~~ de ~~protiste (Paramecia), d~~'~~organisme animal comme la limnée (genre Lymnaea) ou d~~'~~organisme végétal comme le blé (genre Triticum),~~
	* Séquençage de transcriptomes d'~~organismes eucaryotes comme le chêne (genre Quercus)~~,
	* Projets de métagénomique et ~~de métatranscriptomique (projets Tara Océans, biodiversité~~ des ~~sols français)~~
	* Projets de ~~séquençage du Génome~~ de ~~la truffe noire du Périgord~~, ~~du génome d'Ectocarpus.~~
	* 1002 génomes de levures, ~~biodiversité des plantes alpines~~.
	\|Discipline=Vie & Santé		\|Discipline=Vie & Santé
	\|SousDisciplineVie&Sante=LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes		\|SousDisciplineVie&Sante=LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes; LS8 Biologie environnementale, écologie et évolution
	\|Thematique=Plateforme de bioinformatique		\|Thematique=Plateforme de bioinformatique, Biodiversité
	\|TypeDonnee=Données génomiques		\|TypeDonnee=Données génomiques, Données de séquençage
	\|Communaute=Communautés scientifiques académiques		\|Communaute=Communautés scientifiques académiques
	\|Beneficiaire=Chercheurs, Enseignants-Chercheurs, Médecins		\|Beneficiaire=Chercheurs, Enseignants-Chercheurs, Médecins

SidonieRaffy le 13 décembre 2024 à 09:08

2024-12-13T09:08:15Z

← Version précédente		Version du 13 décembre 2024 à 11:08
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	\|Communaute=Communautés scientifiques académiques		\|Communaute=Communautés scientifiques académiques
	\|Beneficiaire=Chercheurs, Enseignants-Chercheurs, Médecins		\|Beneficiaire=Chercheurs, Enseignants-Chercheurs, Médecins
	\|ConditionUsage=~~La soumission~~ de projets s’effectue via le site de France Génomique		\|ConditionUsage=Les soumissions de projets s’effectue via le site de France Génomique
			\|ModeleEconomique=Les projets sont co-financés avec les laboratoires demandeurs.
	\|Relation=France Génomique		\|Relation=France Génomique
	}}		}}

SidonieRaffy le 13 décembre 2024 à 08:57

2024-12-13T08:57:14Z

← Version précédente		Version du 13 décembre 2024 à 10:57
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	\|Thematique=Plateforme de bioinformatique		\|Thematique=Plateforme de bioinformatique
	\|TypeDonnee=Données génomiques		\|TypeDonnee=Données génomiques
			\|Communaute=Communautés scientifiques académiques
			\|Beneficiaire=Chercheurs, Enseignants-Chercheurs, Médecins
			\|ConditionUsage=La soumission de projets s’effectue via le site de France Génomique
	\|Relation=France Génomique		\|Relation=France Génomique
	~~\|StatutPage=Page en construction~~
	}}		}}

SidonieRaffy le 10 décembre 2024 à 12:10

2024-12-10T12:10:41Z

← Version précédente		Version du 10 décembre 2024 à 14:10
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	{{ServiceStructure		{{ServiceStructure
	\|Description=L'équipe du '''laboratoire de séquençage du Genoscope''' s'implique dans la prise en main des projets à partir de la réception des échantillons jusqu'à la validation des séquences brutes.Le séquençage est assuré par des séquenceurs très haut débit de deuxième génération. Ces machines permettent d'atteindre un débit autorisant le séquençage de génomes entiers dans un intervalle de temps limité.		\|Description=L'équipe du '''laboratoire de séquençage du Genoscope''' s'implique dans la prise en main des projets à partir de la réception des échantillons jusqu'à la validation des séquences brutes. Le séquençage est assuré par des séquenceurs très haut débit de deuxième génération. Ces machines permettent d'atteindre un débit autorisant le séquençage de génomes entiers dans un intervalle de temps limité.


	Les projets actuellement développés concernent un large panel d'organismes, par exemple :		Les projets actuellement développés concernent un large panel d'organismes, par exemple :

	* Reséquençage : champignon unicellulaire comme la levure (Saccharomyces cerevisiae) ou organisme végétal comme le riz (genre Oryza),		* Reséquençage : champignon unicellulaire comme la levure (Saccharomyces cerevisiae) ou organisme végétal comme le riz (genre Oryza),
	* Séquençage de novo de protiste (Paramecia), d'organisme animal comme la limnée (genre Lymnaea) ou d'organisme végétal comme le blé (genre Triticum),		* Séquençage de novo de protiste (Paramecia), d'organisme animal comme la limnée (genre Lymnaea) ou d'organisme végétal comme le blé (genre Triticum),
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	\|SousDisciplineVie&Sante=LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes		\|SousDisciplineVie&Sante=LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes
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SidonieRaffy le 9 décembre 2024 à 16:08

2024-12-09T16:08:39Z

← Version précédente		Version du 9 décembre 2024 à 18:08
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	\|Description=L'équipe du laboratoire de séquençage s'implique dans la prise en main des projets à partir de la réception des échantillons jusqu'à la validation des séquences brutes.Le séquençage est assuré par des séquenceurs très haut débit de deuxième génération. Ces machines permettent d'atteindre un débit autorisant le séquençage de génomes entiers dans un intervalle de temps limité.		\|Description=L'équipe du '''laboratoire de séquençage du Genoscope''' s'implique dans la prise en main des projets à partir de la réception des échantillons jusqu'à la validation des séquences brutes.Le séquençage est assuré par des séquenceurs très haut débit de deuxième génération. Ces machines permettent d'atteindre un débit autorisant le séquençage de génomes entiers dans un intervalle de temps limité.

	Les projets traités par le laboratoire de séquençage sont essentiellement de grands projets acceptés suite aux appels d'offres Genoscope et, plus récemment depuis 2012, aux appels d'offres France Génomique "Grands Projets de Séquençage option Biodiversité". Le laboratoire de séquençage prend également en charge tous les projets propres dont les porteurs de projet des équipes scientifiques du Genoscope.

	Les projets actuellement développés concernent un large panel d'organismes, par exemple :		Les projets actuellement développés concernent un large panel d'organismes, par exemple :
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	* 1002 génomes de levures, biodiversité des plantes alpines.		* 1002 génomes de levures, biodiversité des plantes alpines.
	\|Discipline=Vie & Santé		\|Discipline=Vie & Santé
			\|SousDisciplineVie&Sante=LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes
			\|Thematique=Plateforme de bioinformatique
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	\|StatutPage=Page en construction		\|StatutPage=Page en construction
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