BiP - Historique des versions

IsabelleCao le 9 mars 2026 à 15:35

2026-03-09T15:35:00Z

← Version précédente		Version du 9 mars 2026 à 17:35
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	\|Thematique=Plateforme de bioinformatique, Séquençage haut débit		\|Thematique=Plateforme de bioinformatique, Séquençage haut débit
	\|TypeDonnee=Données biologiques, Données de séquençage haut débit		\|TypeDonnee=Données biologiques, Données de séquençage haut débit
			\|PerimetreCommunaute=ESR, national
	\|Communaute=Communautés scientifiques de l'ensemble des établissements partenaires		\|Communaute=Communautés scientifiques de l'ensemble des établissements partenaires
	\|Beneficiaire=Chercheurs ; Enseignants-chercheurs ; Doctorants		\|Beneficiaire=Chercheurs ; Enseignants-chercheurs ; Doctorants

Raphaël le 17 avril 2025 à 12:15

2025-04-17T12:15:46Z

← Version précédente		Version du 17 avril 2025 à 14:15
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	\|Thematique=Plateforme de bioinformatique, Séquençage haut débit		\|Thematique=Plateforme de bioinformatique, Séquençage haut débit
	\|TypeDonnee=Données biologiques, Données de séquençage haut débit		\|TypeDonnee=Données biologiques, Données de séquençage haut débit
			\|Communaute=Communautés scientifiques de l'ensemble des établissements partenaires
			\|Beneficiaire=Chercheurs ; Enseignants-chercheurs ; Doctorants
	\|ConditionUsage=Chaque personne travaillant dans un institut partenaire peut faire une demande de compte sur les ressources de calcul via le Formulaire d’ouverture de compte.		\|ConditionUsage=Chaque personne travaillant dans un institut partenaire peut faire une demande de compte sur les ressources de calcul via le Formulaire d’ouverture de compte.
	Les personnes travaillant dans un institut non partenaire peuvent contacter le responsable de plateforme pour une demande de partenariat.		Les personnes travaillant dans un institut non partenaire peuvent contacter le responsable de plateforme pour une demande de partenariat.
	\|Certification=CoRTecS; https://cortecs.unistra.fr/les-plateformes/toutes-les-plateformes/detail/57-plateforme-de-bioinformatique		\|Certification=CoRTecS; https://cortecs.unistra.fr/les-plateformes/toutes-les-plateformes/detail/57-plateforme-de-bioinformatique
	\|Cgu=https://www.ibmp.cnrs.fr/app/uploads/2021/02/Charte-Fonctionnement_HPC_IBMP.pdf		\|Cgu=https://www.ibmp.cnrs.fr/app/uploads/2021/02/Charte-Fonctionnement_HPC_IBMP.pdf
			\|Relation=FBI
	}}		}}

Raphaël le 17 avril 2025 à 12:12

2025-04-17T12:12:29Z

← Version précédente		Version du 17 avril 2025 à 14:12
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	\|StructureAppartenance=IBMP		\|StructureAppartenance=IBMP
	\|Tutelle=CNRS, Université de Strasbourg		\|Tutelle=CNRS, Université de Strasbourg
	\|PhaseCycleVie=Collecte, Analyse		\|PhaseCycleVie=Collecte, Analyse, Stockage
	\|International=Non		\|International=Non
			}}
			{{Coordonnées GPS
			\|CoordonneeGeographique=48.58082, 7.7636
	}}		}}
	{{Service		{{Service
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	'''Missions:'''		'''Missions:'''
	– Analyse de données biologiques		* Analyse de données biologiques
	– Mise en place des ressources de calcul en bioinformatique		* Mise en place des ressources de calcul en bioinformatique
	– Formation à destination de biologistes ou bioinformaticiens (Accès aux formations).		* Formation à destination de biologistes ou bioinformaticiens (Accès aux formations).


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	La plateforme possède des compétences en analyses de données NGS, plus particulièrement Illumina et Nanopore. Elles couvrent différentes thématiques, entre autres :		La plateforme possède des compétences en analyses de données NGS, plus particulièrement Illumina et Nanopore. Elles couvrent différentes thématiques, entre autres :
	– l’assemblage de génomes~~<br>~~		* l’assemblage de génomes
	– la détection de variants~~<br>~~		* la détection de variants
	– l’étude du transcriptome (RNA-seq et smallRNA-seq)~~<br>~~		* l’étude du transcriptome (RNA-seq et smallRNA-seq)
	– la métagénomique 16S~~<br>~~		* la métagénomique 16S
	– les interactions protéines/adn-arn (ChIP-seq, ….)~~<br>~~		* les interactions protéines/adn-arn (ChIP-seq, ….)
	– la méthylation~~<br>~~		* la méthylation

	La plateforme travaille en synergie avec la plateforme AEG pour une prise globale des projets de la définition du plan expérimental à l’exploitation des résultats.		La plateforme travaille en synergie avec la plateforme AEG pour une prise globale des projets de la définition du plan expérimental à l’exploitation des résultats.
	\|Discipline=Vie & Santé		\|Discipline=Vie & Santé
	\|TypeDonnee=Données biologiques~~<br>~~		\|SousDisciplineVie&Sante=LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes
	Données de séquençage haut débit		\|Thematique=Plateforme de bioinformatique, Séquençage haut débit
			\|TypeDonnee=Données biologiques, Données de séquençage haut débit
	\|ConditionUsage=Chaque personne travaillant dans un institut partenaire peut faire une demande de compte sur les ressources de calcul via le Formulaire d’ouverture de compte.		\|ConditionUsage=Chaque personne travaillant dans un institut partenaire peut faire une demande de compte sur les ressources de calcul via le Formulaire d’ouverture de compte.
	Les personnes travaillant dans un institut non partenaire peuvent contacter le responsable de plateforme pour une demande de partenariat.		Les personnes travaillant dans un institut non partenaire peuvent contacter le responsable de plateforme pour une demande de partenariat.
	\|Certification=~~Cortecs~~; https://cortecs.unistra.fr/les-plateformes/toutes-les-plateformes/detail/57-plateforme-de-bioinformatique		\|Certification=CoRTecS; https://cortecs.unistra.fr/les-plateformes/toutes-les-plateformes/detail/57-plateforme-de-bioinformatique
			\|Cgu=https://www.ibmp.cnrs.fr/app/uploads/2021/02/Charte-Fonctionnement_HPC_IBMP.pdf
	}}		}}

Aline Grand le 16 avril 2025 à 13:37

2025-04-16T13:37:01Z

← Version précédente		Version du 16 avril 2025 à 15:37
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	La plateforme possède des compétences en analyses de données NGS, plus particulièrement Illumina et Nanopore. Elles couvrent différentes thématiques, entre autres :		La plateforme possède des compétences en analyses de données NGS, plus particulièrement Illumina et Nanopore. Elles couvrent différentes thématiques, entre autres :
	– l’assemblage de génomes,		– l’assemblage de génomes<br>
	– la détection de variants,		– la détection de variants<br>
	– l’étude du transcriptome (RNA-seq et smallRNA-seq),		– l’étude du transcriptome (RNA-seq et smallRNA-seq)<br>
	– la métagénomique 16S,		– la métagénomique 16S<br>
	– les interactions protéines/adn-arn (ChIP-seq, ….)		– les interactions protéines/adn-arn (ChIP-seq, ….)<br>
	– la méthylation.		– la méthylation<br>
	~~Notre~~ plateforme travaille en synergie avec la plateforme AEG pour une prise globale des projets de la définition du plan expérimental à l’exploitation des résultats.
			La plateforme travaille en synergie avec la plateforme AEG pour une prise globale des projets de la définition du plan expérimental à l’exploitation des résultats.
	\|Discipline=Vie & Santé		\|Discipline=Vie & Santé
	\|TypeDonnee=Données biologiques		\|TypeDonnee=Données biologiques<br>
	Données de séquençage haut débit		Données de séquençage haut débit
	\|ConditionUsage=Chaque personne travaillant dans un institut partenaire peut faire une demande de compte sur les ressources de calcul via le Formulaire d’ouverture de compte.		\|ConditionUsage=Chaque personne travaillant dans un institut partenaire peut faire une demande de compte sur les ressources de calcul via le Formulaire d’ouverture de compte.

Aline Grand : Page créée avec « {{Infobox Service |Logo=BiP-logo2.png |NomService=BiP |TypeService=Plateforme de calcul |StatutService=En production |NomDéveloppé=Bioinformatics Platform |UrlService=https://www.ibmp.cnrs.fr/plateformes/bioinformatique/ |ContactMel=Valerie.cognat@ibmp.unistra.fr |Localisation=Strasbourg |StructureAppartenance=IBMP |Tutelle=CNRS, Université de Strasbourg |PhaseCycleVie=Collecte, Analyse |International=Non }} {{Service |Description=La plateforme de bioinformati... »

2025-04-16T13:28:47Z

Page créée avec « {{Infobox Service |Logo=BiP-logo2.png |NomService=BiP |TypeService=Plateforme de calcul |StatutService=En production |NomDéveloppé=Bioinformatics Platform |UrlService=https://www.ibmp.cnrs.fr/plateformes/bioinformatique/ |ContactMel=Valerie.cognat@ibmp.unistra.fr |Localisation=Strasbourg |StructureAppartenance=IBMP |Tutelle=CNRS, Université de Strasbourg |PhaseCycleVie=Collecte, Analyse |International=Non }} {{Service |Description=La plateforme de bioinformati... »

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{{Infobox Service
|Logo=BiP-logo2.png
|NomService=BiP
|TypeService=Plateforme de calcul
|StatutService=En production
|NomDéveloppé=Bioinformatics Platform
|UrlService=https://www.ibmp.cnrs.fr/plateformes/bioinformatique/
|ContactMel=Valerie.cognat@ibmp.unistra.fr
|Localisation=Strasbourg
|StructureAppartenance=IBMP
|Tutelle=CNRS, Université de Strasbourg
|PhaseCycleVie=Collecte, Analyse
|International=Non
}}
{{Service
|Description=La plateforme de bioinformatique conseille, propose et développe des services en bioinformatique à destination des équipes de recherches. Ses domaines couvrent plus particulièrement l’analyse de données de séquençage haut débit.

'''Missions:'''
– Analyse de données biologiques
– Mise en place des ressources de calcul en bioinformatique
– Formation à destination de biologistes ou bioinformaticiens (Accès aux formations).

'''Expertises'''
'''Analyse de données de séquençage haut débit'''

La plateforme possède des compétences en analyses de données NGS, plus particulièrement Illumina et Nanopore. Elles couvrent différentes thématiques, entre autres :
– l’assemblage de génomes,
– la détection de variants,
– l’étude du transcriptome (RNA-seq et smallRNA-seq),
– la métagénomique 16S,
– les interactions protéines/adn-arn (ChIP-seq, ….)
– la méthylation.
Notre plateforme travaille en synergie avec la plateforme AEG pour une prise globale des projets de la définition du plan expérimental à l’exploitation des résultats.
|Discipline=Vie & Santé
|TypeDonnee=Données biologiques
Données de séquençage haut débit
|ConditionUsage=Chaque personne travaillant dans un institut partenaire peut faire une demande de compte sur les ressources de calcul via le Formulaire d’ouverture de compte.
Les personnes travaillant dans un institut non partenaire peuvent contacter le responsable de plateforme pour une demande de partenariat.
|Certification=Cortecs; https://cortecs.unistra.fr/les-plateformes/toutes-les-plateformes/detail/57-plateforme-de-bioinformatique
}}