ATLASea - Historique des versions

IsabelleCao le 26 janvier 2026 à 15:40

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IsabelleCao le 12 janvier 2026 à 15:37

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SidonieRaffy le 11 avril 2025 à 12:40

2025-04-11T12:40:38Z

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SidonieRaffy le 10 avril 2025 à 08:35

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SidonieRaffy le 20 mars 2024 à 13:09

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	\|Description=Le '''programme de recherche exploratoire ATLASea''' vise à séquencer le génome de 4 500 espèces marines de la zone économique exclusive française.		\|Description=Le '''programme de recherche exploratoire ATLASea''' vise à séquencer le génome de 4 500 espèces marines de la zone économique exclusive française.


	Il est structuré en trois Projets Ciblés (PC) qui récapitulent '''le flux de données, de l’océan vers une information digitalisée accessible à tous''' :		Il est structuré en trois Projets Ciblés (PC) qui récapitulent '''le flux de données, de l’océan vers une information digitalisée accessible à tous''' :

SidonieRaffy le 20 mars 2024 à 13:08

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	Il est structuré en trois Projets Ciblés (PC) qui récapitulent '''le flux de données, de l’océan vers une information digitalisée accessible à tous''' :		Il est structuré en trois Projets Ciblés (PC) qui récapitulent '''le flux de données, de l’océan vers une information digitalisée accessible à tous''' :
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	* '''BYTE-SEA''' qui vise à '''établir l’infrastructure informatique requise pour gérer le flux de données depuis l’échantillonnage jusqu’au versement des données génomique dans le portail ATLASea''' et les dépôts internationaux. Il réalisera également des '''analyses à grande échelle''' pour retracer l’histoire évolutive des génomes et assigner des fonctions aux gènes. Les génomes seront finalement '''stockés dans des bases de données ouvertes et accessibles''' à la communauté internationale.		* '''BYTE-SEA''' qui vise à '''établir l’infrastructure informatique requise pour gérer le flux de données depuis l’échantillonnage jusqu’au versement des données génomique dans le portail ATLASea''' et les dépôts internationaux. Il réalisera également des '''analyses à grande échelle''' pour retracer l’histoire évolutive des génomes et assigner des fonctions aux gènes. Les génomes seront finalement '''stockés dans des bases de données ouvertes et accessibles''' à la communauté internationale.

SidonieRaffy le 20 mars 2024 à 13:08

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	* '''SEQ-SEA''' qui concerne le '''séquençage des génomes'''. L’ADN sera extrait des '''échantillons au Genoscope, puis séquencé et assemblé en génomes de référence, et enfin annoté''' pour identifier la position des gènes. L’objectif est d’aboutir à des génomes de référence, c'est-à-dire complets.		* '''SEQ-SEA''' qui concerne le '''séquençage des génomes'''. L’ADN sera extrait des '''échantillons au Genoscope, puis séquencé et assemblé en génomes de référence, et enfin annoté''' pour identifier la position des gènes. L’objectif est d’aboutir à des génomes de référence, c'est-à-dire complets.

	* '''BYTE-SEA''' qui vise à '''établir l’infrastructure informatique requise pour gérer le flux de données depuis l’échantillonnage jusqu’au versement des données génomique dans le portail ATLASea'' et les dépôts internationaux. Il réalisera également des '''analyses à grande échelle''' pour retracer l’histoire évolutive des génomes et assigner des fonctions aux gènes. Les génomes seront finalement '''stockés dans des bases de données ouvertes et accessibles''' à la communauté internationale.		* '''BYTE-SEA''' qui vise à '''établir l’infrastructure informatique requise pour gérer le flux de données depuis l’échantillonnage jusqu’au versement des données génomique dans le portail ATLASea''' et les dépôts internationaux. Il réalisera également des '''analyses à grande échelle''' pour retracer l’histoire évolutive des génomes et assigner des fonctions aux gènes. Les génomes seront finalement '''stockés dans des bases de données ouvertes et accessibles''' à la communauté internationale.

SidonieRaffy le 20 mars 2024 à 13:08

2024-03-20T13:08:00Z

← Version précédente		Version du 20 mars 2024 à 15:08
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	* '''SEQ-SEA''' qui concerne le '''séquençage des génomes'''. L’ADN sera extrait des '''échantillons au Genoscope, puis séquencé et assemblé en génomes de référence, et enfin annoté''' pour identifier la position des gènes. L’objectif est d’aboutir à des génomes de référence, c'est-à-dire complets.		* '''SEQ-SEA''' qui concerne le '''séquençage des génomes'''. L’ADN sera extrait des '''échantillons au Genoscope, puis séquencé et assemblé en génomes de référence, et enfin annoté''' pour identifier la position des gènes. L’objectif est d’aboutir à des génomes de référence, c'est-à-dire complets.

	* BYTE-SEA qui vise à '''établir l’infrastructure informatique requise pour gérer le flux de données depuis l’échantillonnage jusqu’au versement des données génomique dans le portail ATLASea'' et les dépôts internationaux. Il réalisera également des '''analyses à grande échelle''' pour retracer l’histoire évolutive des génomes et assigner des fonctions aux gènes. Les génomes seront finalement '''stockés dans des bases de données ouvertes et accessibles''' à la communauté internationale.		* '''BYTE-SEA''' qui vise à '''établir l’infrastructure informatique requise pour gérer le flux de données depuis l’échantillonnage jusqu’au versement des données génomique dans le portail ATLASea'' et les dépôts internationaux. Il réalisera également des '''analyses à grande échelle''' pour retracer l’histoire évolutive des génomes et assigner des fonctions aux gènes. Les génomes seront finalement '''stockés dans des bases de données ouvertes et accessibles''' à la communauté internationale.

SidonieRaffy le 20 mars 2024 à 13:07

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	\|SousDisciplineVie&Sante=LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes		\|SousDisciplineVie&Sante=LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes
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{{InfoboxStructure
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{{DescriptionStructure
|Description=Le '''programme de recherche exploratoire ATLASea''' vise à séquencer le génome de 4 500 espèces marines de la zone économique exclusive française.

Il est structuré en trois Projets Ciblés (PC) qui récapitulent '''le flux de données, de l’océan vers une information digitalisée accessible à tous''' :

* '''DIVE-SEA''' qui concerne '''l’échantillonnage des organismes vivants''' dans le milieu marin, en vue de leur séquençage. Il s’appuie sur un réseau de stations marines et prévoit plusieurs expéditions côtières et en haute mer ;

* '''SEQ-SEA''' qui concerne le '''séquençage des génomes'''. L’ADN sera extrait des '''échantillons au Genoscope, puis séquencé et assemblé en génomes de référence, et enfin annoté''' pour identifier la position des gènes. L’objectif est d’aboutir à des génomes de référence, c'est-à-dire complets.

* BYTE-SEA qui vise à '''établir l’infrastructure informatique requise pour gérer le flux de données depuis l’échantillonnage jusqu’au versement des données génomique dans le portail ATLASea'' et les dépôts internationaux. Il réalisera également des '''analyses à grande échelle''' pour retracer l’histoire évolutive des génomes et assigner des fonctions aux gènes. Les génomes seront finalement '''stockés dans des bases de données ouvertes et accessibles''' à la communauté internationale.

Le programme comportera également un important volet formation afin de maintenir le savoir-faire français en termes de séquençage : écoles d’été, workshops, encadrements de doctorants, etc.
|Discipline=Vie & Santé
|SousDisciplineVie&Sante=LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes
|Thematique=Séquençage, Génomes
|Relation=Ifremer, MNHN, Aix-Marseille Université, Sorbonne Université, Université PSL
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