http://cat.opidor.fr/api.php?action=feedcontributions&feedformat=atom&user=Aur%C3%A9lien+Schmitt 2026-04-26T15:29:50Z Contributions MediaWiki 1.43.6 http://cat.opidor.fr/index.php?title=Fichier:Logo-dmitwiki.png&diff=49657 2026-03-20T08:07:56Z

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<p>Aurélien Schmitt : </p> <hr /> <div>{{Infobox Service<br /> |Logo=Minet-logo b155c07e-d9d3-4c8d-a757-607fe24036bc.cover.png<br /> |NomService=Minet<br /> |TypeService=Plateforme d'acquisition<br /> |StatutService=En production<br /> |UrlService=https://medialab.sciencespo.fr/outils/minet/<br /> https://github.com/medialab/minet<br /> |ContactMel=benjamin.ooghe@sciencespo.fr<br /> |Localisation=Paris<br /> |StructureAppartenance=Médialab<br /> |Tutelle=Sciences Po<br /> |PhaseCycleVie=Collecte<br /> |International=Non<br /> }}<br /> {{Service<br /> |Description=Minet est une librairie python et un outil en ligne de commande ayant pour objectif d'aider ses utilisateurs à accomplir de nombreuses tâches typiques de webmining.<br /> <br /> Minet peut par exemple être utilisé pour :<br /> * Télécharger de très nombreuses urls le plus rapidement possible<br /> * Scraper en utilisant un DSL dédié<br /> * Crawler en utilisant un DSL dédié<br /> * Extraire le contenu textuel de pages HTML<br /> * De transformer et/ou parser des lots d'urls<br /> * De collecter des données via certaines APIs comme celles de Crowdtangle ou Media Cloud<br /> <br /> Minet est le produit d'une dizaine d'années d'expérience du laboratoire en webmining et est utilisé aujourd'hui quotidiennement dans le cadre de nombreux projets reposant sur de la collecte de données web.<br /> |Discipline=Sciences Humaines &amp; Sociales<br /> |SousDisciplineSciencesHumaines&amp;Sociales=SH3 Le monde social et ses interactions; SH5 Textes et concepts<br /> |Thematique=webmining , logiciel , média<br /> |TypeOutilsCodes=Forge logicielle<br /> |OuvertureProjet=Public<br /> |PerimetreConstructionLogiciel=Etablissement<br /> |PossibilitePartage=Ouvert<br /> |ForgeSouveraine=Oui<br /> |Communaute=Communautés scientifiques en Sciences Humaines et Sociales<br /> |Beneficiaire=Chercheurs, Enseignants-Chercheurs, Doctorants, Etudiants<br /> |ConditionUsage=GNU General Public License v3.0<br /> |ModeleEconomique=Accès libre et gratuit<br /> }}</div>

Aurélien Schmitt http://cat.opidor.fr/index.php?title=Minet&diff=49655 2026-03-19T13:35:28Z

<p>Aurélien Schmitt : Page créée avec « {{Infobox Service |Logo=Minet-logo b155c07e-d9d3-4c8d-a757-607fe24036bc.cover.png |NomService=Minet |TypeService=Plateforme d&#039;acquisition |StatutService=En production |UrlService=https://medialab.sciencespo.fr/outils/minet/ https://github.com/medialab/minet |ContactMel=benjamin.ooghe@sciencespo.fr |Localisation=Paris |StructureAppartenance=Médialab |Tutelle=Sciences Po |PhaseCycleVie=Collecte |International=Non }} {{Service |Description=Minet est une librairie... »</p> <hr /> <div>{{Infobox Service<br /> |Logo=Minet-logo b155c07e-d9d3-4c8d-a757-607fe24036bc.cover.png<br /> |NomService=Minet<br /> |TypeService=Plateforme d'acquisition<br /> |StatutService=En production<br /> |UrlService=https://medialab.sciencespo.fr/outils/minet/<br /> https://github.com/medialab/minet<br /> |ContactMel=benjamin.ooghe@sciencespo.fr<br /> |Localisation=Paris<br /> |StructureAppartenance=Médialab<br /> |Tutelle=Sciences Po<br /> |PhaseCycleVie=Collecte<br /> |International=Non<br /> }}<br /> {{Service<br /> |Description=Minet est une librairie python et un outil en ligne de commande ayant pour objectif d'aider ses utilisateurs à accomplir de nombreuses tâches typiques de webmining.<br /> <br /> Minet peut par exemple être utilisé pour :<br /> * Télécharger de très nombreuses urls le plus rapidement possible<br /> * Scraper en utilisant un DSL dédié<br /> * Crawler en utilisant un DSL dédié<br /> * Extraire le contenu textuel de pages HTML<br /> * De transformer et/ou parser des lots d'urls<br /> * De collecter des données via certaines APIs comme celles de Crowdtangle ou Media Cloud<br /> <br /> Minet est le produit d'une dizaine d'années d'expérience du laboratoire en webmining et est utilisé aujourd'hui quotidiennement dans le cadre de nombreux projets reposant sur de la collecte de données web.<br /> |Discipline=Sciences Humaines &amp; Sociales<br /> |SousDisciplineSciencesHumaines&amp;Sociales=SH3 Le monde social et ses interactions; SH5 Textes et concepts<br /> |TypeOutilsCodes=Forge logicielle<br /> |OuvertureProjet=Public<br /> |PerimetreConstructionLogiciel=Etablissement<br /> |PossibilitePartage=Ouvert<br /> |ForgeSouveraine=Oui<br /> |Communaute=Communautés scientifiques en Sciences Humaines et Sociales<br /> |Beneficiaire=Chercheurs, Enseignants-Chercheurs, Doctorants, Etudiants<br /> |ConditionUsage=GNU General Public License v3.0<br /> |ModeleEconomique=Accès libre et gratuit<br /> }}</div>

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Aurélien Schmitt http://cat.opidor.fr/index.php?title=Donn%C3%A9es_de_couleur_de_l%E2%80%99oc%C3%A9an&diff=47217 2025-09-22T08:32:42Z

<p>Aurélien Schmitt : Page créée avec « {{Infobox Service |NomService=Catalogue des données de couleur de l’Océan à moyenne résolution |TypeService=Plateforme d&#039;accès |StatutService=En production |UrlService=https://odatis.acri-st.fr/ |ContactMel=vincent.vantrepotte@univ-littoral.fr, david.doxaran@imev-mer.fr |StructureAppartenance=ODATIS |PhaseCycleVie=Analyse, Documentation, Réutilisation |International=Non }} {{Service |Description=Le traitement de données de « couleur de l’océan » est... »</p> <hr /> <div>{{Infobox Service<br /> |NomService=Catalogue des données de couleur de l’Océan à moyenne résolution<br /> |TypeService=Plateforme d'accès<br /> |StatutService=En production<br /> |UrlService=https://odatis.acri-st.fr/<br /> |ContactMel=vincent.vantrepotte@univ-littoral.fr, david.doxaran@imev-mer.fr<br /> |StructureAppartenance=ODATIS<br /> |PhaseCycleVie=Analyse, Documentation, Réutilisation<br /> |International=Non<br /> }}<br /> {{Service<br /> |Description=Le traitement de données de « couleur de l’océan » est réalisé par ACRI-ST sous contrat CNES pour le compte de la communauté scientifique française (Consortium d'expertises scientifiques (CES) Couleur de l’océan) du centre de données ODATIS.<br /> Ce traitement est réalisé en exploitant des algorithmes innovants appliqués à des données à moyenne résolution spatiale (environ 300m). Il est, pour l’instant, focalisé sur les eaux côtières de France métropolitaine. Le résultat de ce traitement est rendu accessible au travers de ce site. L’extraction de « matchup » est aussi possible pour permettre des confrontations (hors de ce site) entre mesure de terrain et restitutions satellite.<br /> <br /> Les données de couleur de l’océan utilisées en entrée de la chaîne de traitement sont de niveau 1 et proviennent des capteurs MERIS (Envisat), MODIS (AQUA), OLCI-A &amp; OLCI-B (Sentinels 3a &amp; 3b)<br /> <br /> Les traitements consistent en l'application parallèle de trois corrections atmosphériques (selon les capteurs), en une reprojection des produits sur une grille plate-carrée régulière puis en l'exécution de neuf algorithmes bio-optiques.<br /> <br /> Les 3 corrections atmosphériques sont :<br /> <br /> * NIR/SWIR (MODIS)<br /> * Polymer (pour les trois capteurs)<br /> * ACOLITE (pour MERIS et OLCI A&amp;B)<br /> <br /> Les algorithmes bio-optiques identifiés par le CES comme les plus pertinents pour l’étude des zones côtières sont CHL-OC5, CHL-GONS, SPM-R, SPM-G, Turbidité, CDOM, DOC, POC, BBP.<br /> |Discipline=Sciences &amp; Technologies<br /> |SousDisciplineSciences&amp;Technologies=PE10 Sciences du Système Terre<br /> |Thematique=couleur de l'océan<br /> |TypeDonnee=NetCDF<br /> }}</div>

Aurélien Schmitt http://cat.opidor.fr/index.php?title=Fichier:Logo-acri-st.png&diff=47214 2025-09-22T07:27:24Z

<p>Aurélien Schmitt : </p> <hr /> <div></div>

Aurélien Schmitt http://cat.opidor.fr/index.php?title=PBM&diff=47175 2025-08-29T13:13:23Z

<p>Aurélien Schmitt : </p> <hr /> <div>{{Infobox Service<br /> |NomService=Plateforme de Biologie Moléculaire de Villefranche (PBM)<br /> |TypeService=Plateforme d'acquisition<br /> |StatutService=En production<br /> |NomDéveloppé=Plateforme de Biologie Moléculaire de Villefranche (PBM)<br /> |NomAlternatifRéduit=PBM<br /> |UrlService=https://www.imev-mer.fr/web/plateforme-de-biologie-moleculaire-de-villefranche-pbm/<br /> |ContactMel=alessandra.contento@imev-mer.fr<br /> |Localisation=Villefranche-sur-Mer<br /> |StructureAppartenance=IMEV, OSU STAMAR, EMBRC France<br /> |Tutelle=Sorbonne Université, CNRS<br /> |PhaseCycleVie=Planification, Collecte, Analyse<br /> |International=Non<br /> }}<br /> {{Coordonnées GPS<br /> |CoordonneeGeographique=43.69652, 7.30651<br /> }}<br /> {{Service<br /> |Description=La Plateforme de Biologie Moléculaire de Villefranche sur Mer existe depuis 2018.<br /> Elle est labellisée au sein de l’IR EMBRC-France.<br /> PBM propose des services de génotypage, de clonage de cDNA et de soutien<br /> technique à différents appareils.<br /> <br /> '''Services offerts :'''''Texte en italique''<br /> <br /> '''Maitrise des techniques'''<br /> * Génotypage par PCR,<br /> * Clonage dans différents vecteurs plasmidiques (pGEM-Teasy, système Gateway,<br /> * vecteur d’expression pCS2+),<br /> * Mise à disposition d’équipements (Nanodrop, qPCR, Bioanalyseur).<br /> <br /> '''Maitrise de logiciels d’analyse de séquence ADN'''<br /> * Choix des amorces<br /> * Analyse des séquences brutes après séquençage<br /> - Recherche dans des banques de données<br /> - Alignement de séquences, arbres phylogénétiques<br /> La plateforme garantit la confidentialité des données et des résultats<br /> |Discipline=Vie &amp; Santé<br /> |SousDisciplineVie&amp;Sante=LS1 Molécules de la vie : Mécanismes biologiques, structures et fonctions; LS3 Biologie cellulaire, développement, cellules souches et régénération; LS8 Biologie environnementale, écologie et évolution<br /> |Thematique=Séquençage génomique, Génomique environnementale, Métagénomique, Métabarcoding<br /> |TypeDonnee=Données génomiques (FASTA, FASTQ)<br /> }}</div>

Aurélien Schmitt http://cat.opidor.fr/index.php?title=Bio2Mar&diff=47174 2025-08-29T13:12:33Z

<p>Aurélien Schmitt : </p> <hr /> <div>{{Infobox Service<br /> |Logo=Bio2mar.png<br /> |NomService=Bio2Mar<br /> |TypeService=Plateforme d'acquisition<br /> |StatutService=En production<br /> |NomDéveloppé=plateforme Biodiversité et Biotechnologies marines (Bio2Mar)<br /> |NomAlternatifRéduit=Bio2Mar<br /> |UrlService=https://www.obs-banyuls.fr/fr/rechercher/plateformes/bio2mar.html<br /> |ContactMel=karine.escoubeyrou@obs-banyuls.fr<br /> |Localisation=Banyuls<br /> |StructureAppartenance=Sorbonne Université, CNRS, EMBRC France<br /> |Tutelle=Sorbonne Université, CNRS<br /> |PhaseCycleVie=Planification, Collecte, Analyse<br /> |International=Non<br /> }}<br /> {{Service<br /> |Description=La plateforme Biodiversité et Biotechnologies marines « Bio2Mar », est une plateforme régionale labellisée GEPETO (Grand équipement pour l'évolution technologique et l'ouverture scientifique) par la région Occitanie Pyrénées Méditerranée.<br /> <br /> Cette plateforme créée en 2010 offre aux chercheurs des secteurs public et privé une expertise et une technologie de pointe en matière de recherche sur la biodiversité marine et les biotechnologies bleues avec une position stratégique sur le littoral méditerranéen.<br /> <br /> Bio2Mar est unique en offrant une chaine de développement complète allant de l'isolement d'organismes marins, leur identification, la production de biomasse, et la purification et caractérisation structurale des biomolécules d'intérêt. La plateforme s'appuie sur des expertises multidisciplinaires et interdépendantes en microbiologie, biologie moléculaire et chimie permettant la valorisation de la biodiversité marine avec notamment la valorisation de la diversité chimique issue de cette biodiversité.<br /> <br /> Ces approches multidisciplinaires nous permettent d'intervenir dans plusieurs domaines de développement pour la santé et le bien être humain, et l'environnement. Au-delà de cette vocation de développement en biotechnologie bleue, les équipements et les expertises de la plateforme peuvent aussi contribuer aux activités de recherche dans différents domaines tels que la qualité de l'environnement, l'aquaculture, l'écologie microbienne et l'écologie chimique.<br /> <br /> <br /> <br /> Bio2Mar compte une équipe de 8 personnes aux compétences et techniques complémentaires réparties sur 4 plateaux techniques spécialisés et localisés sur 2 sites géographiques.<br /> <br /> La Fédération de Recherche à l'Observatoire Océanologique de Banyuls héberge trois des quatre plateaux techniques :<br /> <br /> Plateau de Biodiversité et Biologie Moléculaire<br /> Plateau de Microbiologie et Culture<br /> Plateau de Biomolécules et Chimie Environnementale.<br /> <br /> Le Centre de Recherches Insulaires et Observatoire de l'Environnement à l'Université de Perpignan (UPVD-CRIOBE) héberge le plateau technique « Métabolites Secondaires, Xénobiotiques et Métabolomique » (MSXM)<br /> |Discipline=Vie &amp; Santé<br /> |SousDisciplineVie&amp;Sante=LS1 Molécules de la vie : Mécanismes biologiques, structures et fonctions; LS3 Biologie cellulaire, développement, cellules souches et régénération; LS8 Biologie environnementale, écologie et évolution<br /> |Thematique=Séquençage génomique, Génomique environnementale, Métagénomique, Métabarcoding<br /> |TypeDonnee=Données génomiques (FASTA, FASTQ)<br /> }}</div>

Aurélien Schmitt http://cat.opidor.fr/index.php?title=Fichier:LogoFasteris.PNG&diff=47167 2025-08-29T09:31:33Z

<p>Aurélien Schmitt : </p> <hr /> <div></div>

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<p>Aurélien Schmitt : </p> <hr /> <div></div>

Aurélien Schmitt http://cat.opidor.fr/index.php?title=Bio2Mar&diff=47164 2025-08-28T14:32:00Z

<p>Aurélien Schmitt : </p> <hr /> <div>{{Infobox Service<br /> |Logo=Bio2mar.png<br /> |NomService=Bio2Mar<br /> |TypeService=Plateforme d'acquisition<br /> |StatutService=En production<br /> |NomDéveloppé=plateforme Biodiversité et Biotechnologies marines (Bio2Mar)<br /> |NomAlternatifRéduit=Bio2Mar<br /> |UrlService=https://www.obs-banyuls.fr/fr/rechercher/plateformes/bio2mar.html<br /> |ContactMel=karine.escoubeyrou@obs-banyuls.fr<br /> |Localisation=Banyuls<br /> |StructureAppartenance=Sorbonne Université, CNRS, EMBRC France<br /> |Tutelle=Sorbonne Université, CNRS<br /> |PhaseCycleVie=Planification, Collecte, Analyse, Documentation<br /> |International=Non<br /> }}<br /> {{Service<br /> |Description=La plateforme Biodiversité et Biotechnologies marines « Bio2Mar », est une plateforme régionale labellisée GEPETO (Grand équipement pour l'évolution technologique et l'ouverture scientifique) par la région Occitanie Pyrénées Méditerranée.<br /> <br /> Cette plateforme créée en 2010 offre aux chercheurs des secteurs public et privé une expertise et une technologie de pointe en matière de recherche sur la biodiversité marine et les biotechnologies bleues avec une position stratégique sur le littoral méditerranéen.<br /> <br /> Bio2Mar est unique en offrant une chaine de développement complète allant de l'isolement d'organismes marins, leur identification, la production de biomasse, et la purification et caractérisation structurale des biomolécules d'intérêt. La plateforme s'appuie sur des expertises multidisciplinaires et interdépendantes en microbiologie, biologie moléculaire et chimie permettant la valorisation de la biodiversité marine avec notamment la valorisation de la diversité chimique issue de cette biodiversité.<br /> <br /> Ces approches multidisciplinaires nous permettent d'intervenir dans plusieurs domaines de développement pour la santé et le bien être humain, et l'environnement. Au-delà de cette vocation de développement en biotechnologie bleue, les équipements et les expertises de la plateforme peuvent aussi contribuer aux activités de recherche dans différents domaines tels que la qualité de l'environnement, l'aquaculture, l'écologie microbienne et l'écologie chimique.<br /> <br /> <br /> <br /> Bio2Mar compte une équipe de 8 personnes aux compétences et techniques complémentaires réparties sur 4 plateaux techniques spécialisés et localisés sur 2 sites géographiques.<br /> <br /> La Fédération de Recherche à l'Observatoire Océanologique de Banyuls héberge trois des quatre plateaux techniques :<br /> <br /> Plateau de Biodiversité et Biologie Moléculaire<br /> Plateau de Microbiologie et Culture<br /> Plateau de Biomolécules et Chimie Environnementale.<br /> <br /> Le Centre de Recherches Insulaires et Observatoire de l'Environnement à l'Université de Perpignan (UPVD-CRIOBE) héberge le plateau technique « Métabolites Secondaires, Xénobiotiques et Métabolomique » (MSXM)<br /> |Discipline=Vie &amp; Santé<br /> |SousDisciplineVie&amp;Sante=LS1 Molécules de la vie : Mécanismes biologiques, structures et fonctions; LS3 Biologie cellulaire, développement, cellules souches et régénération; LS8 Biologie environnementale, écologie et évolution<br /> |Thematique=Séquençage génomique, Génomique environnementale, Métagénomique, Métabarcoding<br /> |TypeDonnee=Données génomiques (FASTA, FASTQ)<br /> }}</div>

Aurélien Schmitt http://cat.opidor.fr/index.php?title=Plateforme_GENOMER&diff=47163 2025-08-28T14:24:50Z

<p>Aurélien Schmitt : </p> <hr /> <div>{{Infobox Service<br /> |Logo=Logo genomer.png<br /> |NomService=Plateforme GENOMER<br /> |TypeService=Plateforme d'acquisition<br /> |StatutService=En production<br /> |NomDéveloppé=Genomer - Plateforme de génomique<br /> |UrlService=www.sb-roscoff.fr/genomer<br /> |ContactMel=pf-genomer@sb-roscoff.fr<br /> |Localisation=Roscoff<br /> |StructureAppartenance=SBR, OSU STAMAR, EMBRC France<br /> |Tutelle=Sorbonne Université, CNRS<br /> |PhaseCycleVie=Planification, Collecte, Analyse, Documentation<br /> |International=Non<br /> }}<br /> {{Coordonnées GPS<br /> |CoordonneeGeographique=48.72672, -3.98786<br /> }}<br /> {{Service<br /> |Description=Les missions de la '''Plateforme Genomer''' sont de :<br /> * mettre à disposition des équipements performants, conseiller et assurer la formation des utilisateurs : '''Mise A Disposition d’équipements-MAD'''<br /> <br /> * proposer un service d’accompagnement adapté pour la réalisation de projets de recherche : '''Conduite de Projet en Génomique-CPG'''.<br /> <br /> Elle fait partie intégrante de l’axe [[Biogenouest|Biogenouest]] Génomique. Ce réseau a pour but de mettre à disposition de la communauté scientifique, les outils nécessaires pour mener à bien des projets de séquençage et/ou de genotypage à petit, moyen, et haut débit, dans les domaines de la mer, de l’agronomie et de la santé.<br /> <br /> La plateforme Genomer (composante de Biogenouest Génomique) est labellisée IBiSA depuis avril 2012.<br /> <br /> La plateforme accueille des chercheurs dans le cadre de collaboration et de l’infrastructure nationale en Biologie et Santé : [[EMBRC France|EMBRC FR]].<br /> |Discipline=Vie &amp; Santé<br /> |SousDisciplineVie&amp;Sante=LS1 Molécules de la vie : Mécanismes biologiques, structures et fonctions; LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes; LS8 Biologie environnementale, écologie et évolution<br /> |Thematique=Séquençage génomique, Génomique environnementale, Métagénomique, Métabarcoding<br /> |TypeDonnee=Données génomiques (FASTA, FASTQ)<br /> |Communaute=Laboratoires académiques<br /> |Beneficiaire=Communauté scientifique de Biogenouest<br /> |ConditionUsage=Il est demandé de renseigner une « Fiche Contact » qui sera analysé par l’équipe de la plateforme Genomer pour examiner la faisabilité du projet. Quand le projet est suffisamment abouti et clairement défini, une fiche d'engagement Conduite de Projet en Génomique (CPG) et un devis sont édités. Le projet débute dès réception des documents (fiche d'engagement signée et bon de commande).<br /> |ModeleEconomique=Payant<br /> |Relation=Biogenouest<br /> }}</div>

Aurélien Schmitt http://cat.opidor.fr/index.php?title=Bio2Mar&diff=47162 2025-08-28T14:04:43Z

<p>Aurélien Schmitt : Page créée avec « {{Infobox Service |Logo=Bio2mar.png |NomService=Bio2Mar |TypeService=Plateforme d&#039;acquisition |StatutService=En production |NomDéveloppé=plateforme Biodiversité et Biotechnologies marines (Bio2Mar) |NomAlternatifRéduit=Bio2Mar |UrlService=https://www.obs-banyuls.fr/fr/rechercher/plateformes/bio2mar.html |ContactMel=karine.escoubeyrou@obs-banyuls.fr |Localisation=Banyuls |StructureAppartenance=Sorbonne Université, CNRS, EMBRC France |Tutelle=Sorbonne Universi... »</p> <hr /> <div>{{Infobox Service<br /> |Logo=Bio2mar.png<br /> |NomService=Bio2Mar<br /> |TypeService=Plateforme d'acquisition<br /> |StatutService=En production<br /> |NomDéveloppé=plateforme Biodiversité et Biotechnologies marines (Bio2Mar)<br /> |NomAlternatifRéduit=Bio2Mar<br /> |UrlService=https://www.obs-banyuls.fr/fr/rechercher/plateformes/bio2mar.html<br /> |ContactMel=karine.escoubeyrou@obs-banyuls.fr<br /> |Localisation=Banyuls<br /> |StructureAppartenance=Sorbonne Université, CNRS, EMBRC France<br /> |Tutelle=Sorbonne Université, CNRS<br /> |International=Non<br /> }}<br /> {{Service<br /> |Description=La plateforme Biodiversité et Biotechnologies marines « Bio2Mar », est une plateforme régionale labellisée GEPETO (Grand équipement pour l'évolution technologique et l'ouverture scientifique) par la région Occitanie Pyrénées Méditerranée.<br /> <br /> Cette plateforme créée en 2010 offre aux chercheurs des secteurs public et privé une expertise et une technologie de pointe en matière de recherche sur la biodiversité marine et les biotechnologies bleues avec une position stratégique sur le littoral méditerranéen.<br /> <br /> Bio2Mar est unique en offrant une chaine de développement complète allant de l'isolement d'organismes marins, leur identification, la production de biomasse, et la purification et caractérisation structurale des biomolécules d'intérêt. La plateforme s'appuie sur des expertises multidisciplinaires et interdépendantes en microbiologie, biologie moléculaire et chimie permettant la valorisation de la biodiversité marine avec notamment la valorisation de la diversité chimique issue de cette biodiversité.<br /> <br /> Ces approches multidisciplinaires nous permettent d'intervenir dans plusieurs domaines de développement pour la santé et le bien être humain, et l'environnement. Au-delà de cette vocation de développement en biotechnologie bleue, les équipements et les expertises de la plateforme peuvent aussi contribuer aux activités de recherche dans différents domaines tels que la qualité de l'environnement, l'aquaculture, l'écologie microbienne et l'écologie chimique.<br /> <br /> <br /> <br /> Bio2Mar compte une équipe de 8 personnes aux compétences et techniques complémentaires réparties sur 4 plateaux techniques spécialisés et localisés sur 2 sites géographiques.<br /> <br /> La Fédération de Recherche à l'Observatoire Océanologique de Banyuls héberge trois des quatre plateaux techniques :<br /> <br /> Plateau de Biodiversité et Biologie Moléculaire<br /> Plateau de Microbiologie et Culture<br /> Plateau de Biomolécules et Chimie Environnementale.<br /> <br /> Le Centre de Recherches Insulaires et Observatoire de l'Environnement à l'Université de Perpignan (UPVD-CRIOBE) héberge le plateau technique « Métabolites Secondaires, Xénobiotiques et Métabolomique » (MSXM)<br /> |Discipline=Vie &amp; Santé<br /> |SousDisciplineVie&amp;Sante=LS1 Molécules de la vie : Mécanismes biologiques, structures et fonctions; LS3 Biologie cellulaire, développement, cellules souches et régénération; LS8 Biologie environnementale, écologie et évolution<br /> |Thematique=Séquençage génomique, Génomique environnementale, Métagénomique, Métabarcoding<br /> |TypeDonnee=Données génomiques (FASTA, FASTQ)<br /> }}</div>

Aurélien Schmitt http://cat.opidor.fr/index.php?title=Fichier:Bio2mar.png&diff=47161 2025-08-28T13:53:38Z

<p>Aurélien Schmitt : </p> <hr /> <div></div>

Aurélien Schmitt http://cat.opidor.fr/index.php?title=PBM&diff=47160 2025-08-28T13:47:03Z

<p>Aurélien Schmitt : </p> <hr /> <div>{{Infobox Service<br /> |NomService=Plateforme de Biologie Moléculaire de Villefranche (PBM)<br /> |TypeService=Plateforme d'acquisition<br /> |StatutService=En production<br /> |NomDéveloppé=Plateforme de Biologie Moléculaire de Villefranche (PBM)<br /> |NomAlternatifRéduit=PBM<br /> |UrlService=https://www.imev-mer.fr/web/plateforme-de-biologie-moleculaire-de-villefranche-pbm/<br /> |ContactMel=alessandra.contento@imev-mer.fr<br /> |Localisation=Villefranche-sur-Mer<br /> |StructureAppartenance=IMEV, OSU STAMAR, EMBRC France<br /> |Tutelle=Sorbonne Université, CNRS<br /> |PhaseCycleVie=Planification, Collecte, Analyse, Documentation<br /> |International=Non<br /> }}<br /> {{Coordonnées GPS<br /> |CoordonneeGeographique=43.69652, 7.30651<br /> }}<br /> {{Service<br /> |Description=La Plateforme de Biologie Moléculaire de Villefranche sur Mer existe depuis 2018.<br /> Elle est labellisée au sein de l’IR EMBRC-France.<br /> PBM propose des services de génotypage, de clonage de cDNA et de soutien<br /> technique à différents appareils.<br /> <br /> '''Services offerts :'''''Texte en italique''<br /> <br /> '''Maitrise des techniques'''<br /> * Génotypage par PCR,<br /> * Clonage dans différents vecteurs plasmidiques (pGEM-Teasy, système Gateway,<br /> * vecteur d’expression pCS2+),<br /> * Mise à disposition d’équipements (Nanodrop, qPCR, Bioanalyseur).<br /> <br /> '''Maitrise de logiciels d’analyse de séquence ADN'''<br /> * Choix des amorces<br /> * Analyse des séquences brutes après séquençage<br /> - Recherche dans des banques de données<br /> - Alignement de séquences, arbres phylogénétiques<br /> La plateforme garantit la confidentialité des données et des résultats<br /> |Discipline=Vie &amp; Santé<br /> |SousDisciplineVie&amp;Sante=LS1 Molécules de la vie : Mécanismes biologiques, structures et fonctions; LS3 Biologie cellulaire, développement, cellules souches et régénération; LS8 Biologie environnementale, écologie et évolution<br /> |Thematique=Séquençage génomique, Génomique environnementale, Métagénomique, Métabarcoding<br /> |TypeDonnee=Données génomiques (FASTA, FASTQ)<br /> }}</div>

Aurélien Schmitt http://cat.opidor.fr/index.php?title=PBM&diff=47159 2025-08-28T13:46:01Z

<p>Aurélien Schmitt : Page créée avec « {{Infobox Service |NomService=Plateforme de Biologie Moléculaire de Villefranche (PBM) |TypeService=Plateforme d&#039;acquisition |StatutService=En production |NomDéveloppé=Plateforme de Biologie Moléculaire de Villefranche (PBM) |NomAlternatifRéduit=PBM |UrlService=https://www.imev-mer.fr/web/plateforme-de-biologie-moleculaire-de-villefranche-pbm/ |ContactMel=alessandra.contento@imev-mer.fr |Localisation=Villefranche-sur-Mer |StructureAppartenance=IMEV, OSU STAM... »</p> <hr /> <div>{{Infobox Service<br /> |NomService=Plateforme de Biologie Moléculaire de Villefranche (PBM)<br /> |TypeService=Plateforme d'acquisition<br /> |StatutService=En production<br /> |NomDéveloppé=Plateforme de Biologie Moléculaire de Villefranche (PBM)<br /> |NomAlternatifRéduit=PBM<br /> |UrlService=https://www.imev-mer.fr/web/plateforme-de-biologie-moleculaire-de-villefranche-pbm/<br /> |ContactMel=alessandra.contento@imev-mer.fr<br /> |Localisation=Villefranche-sur-Mer<br /> |StructureAppartenance=IMEV, OSU STAMAR, EMBRC France<br /> |Tutelle=Sorbonne Université, CNRS<br /> |PhaseCycleVie=Planification, Collecte, Analyse, Documentation<br /> |International=Non<br /> }}<br /> {{Coordonnées GPS<br /> |CoordonneeGeographique=43.69652, 7.30651<br /> }}<br /> {{Service<br /> |Description=La Plateforme de Biologie Moléculaire de Villefranche sur Mer existe depuis 2018.<br /> Elle est labellisée au sein de l’IR EMBRC-France.<br /> PBM propose des services de génotypage, de clonage de cDNA et de soutien<br /> technique à différents appareils.<br /> <br /> '''Services offerts :'''''Texte en italique''<br /> <br /> '''Maitrise des techniques'''<br /> - Génotypage par PCR,<br /> - Clonage dans différents vecteurs plasmidiques (pGEM-Teasy, système Gateway,<br /> vecteur d’expression pCS2+),<br /> - Mise à disposition d’équipements (Nanodrop, qPCR, Bioanalyseur).<br /> <br /> '''Maitrise de logiciels d’analyse de séquence ADN'''<br /> - Choix des amorces<br /> - Analyse des séquences brutes après séquençage<br /> - Recherche dans des banques de données<br /> - Alignement de séquences, arbres phylogénétiques<br /> La plateforme garantit la confidentialité des données et des résultats<br /> |Discipline=Vie &amp; Santé<br /> |SousDisciplineVie&amp;Sante=LS1 Molécules de la vie : Mécanismes biologiques, structures et fonctions; LS3 Biologie cellulaire, développement, cellules souches et régénération; LS8 Biologie environnementale, écologie et évolution<br /> |Thematique=Séquençage génomique, Génomique environnementale, Métagénomique, Métabarcoding<br /> |TypeDonnee=Données génomiques (FASTA, FASTQ)<br /> }}</div>

Aurélien Schmitt http://cat.opidor.fr/index.php?title=Plateforme_GENOMER&diff=47158 2025-08-28T09:39:52Z

<p>Aurélien Schmitt : </p> <hr /> <div>{{Infobox Service<br /> |Logo=Logo genomer.png<br /> |NomService=Plateforme GENOMER<br /> |TypeService=Plateforme d'acquisition<br /> |StatutService=En production<br /> |NomDéveloppé=Genomer - Plateforme de génomique<br /> |UrlService=www.sb-roscoff.fr/genomer<br /> |ContactMel=pf-genomer@sb-roscoff.fr<br /> |Localisation=Roscoff<br /> |StructureAppartenance=SBR, OSU STAMAR, EMBRC France<br /> |Tutelle=Sorbonne Université, CNRS<br /> |PhaseCycleVie=Planification, Collecte, Analyse, Documentation<br /> |International=Non<br /> }}<br /> {{Coordonnées GPS<br /> |CoordonneeGeographique=48.72672, -3.98786<br /> }}<br /> {{Service<br /> |Description=Les missions de la '''Plateforme Genomer''' sont de :<br /> * mettre à disposition des équipements performants, conseiller et assurer la formation des utilisateurs : '''Mise A Disposition d’équipements-MAD'''<br /> <br /> * proposer un service d’accompagnement adapté pour la réalisation de projets de recherche : '''Conduite de Projet en Génomique-CPG'''.<br /> <br /> Elle fait partie intégrante de l’axe [[Biogenouest|Biogenouest]] Génomique. Ce réseau a pour but de mettre à disposition de la communauté scientifique, les outils nécessaires pour mener à bien des projets de séquençage et/ou de genotypage à petit, moyen, et haut débit, dans les domaines de la mer, de l’agronomie et de la santé.<br /> <br /> La plateforme Genomer (composante de Biogenouest Génomique) est labellisée IBiSA depuis avril 2012.<br /> <br /> La plateforme accueille des chercheurs dans le cadre de collaboration et de l’infrastructure nationale en Biologie et Santé : [[EMBRC France|EMBRC FR]].<br /> |Discipline=Vie &amp; Santé<br /> |SousDisciplineVie&amp;Sante=LS1 Molécules de la vie : Mécanismes biologiques, structures et fonctions; LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes; LS8 Biologie environnementale, écologie et évolution<br /> |Thematique=Séquençage génomique, Génomique environnementale, Métagénomique, Métabarcoding<br /> |TypeDonnee=Données génomiques<br /> |Communaute=Laboratoires académiques<br /> |Beneficiaire=Communauté scientifique de Biogenouest<br /> |ConditionUsage=Il est demandé de renseigner une « Fiche Contact » qui sera analysé par l’équipe de la plateforme Genomer pour examiner la faisabilité du projet. Quand le projet est suffisamment abouti et clairement défini, une fiche d'engagement Conduite de Projet en Génomique (CPG) et un devis sont édités. Le projet débute dès réception des documents (fiche d'engagement signée et bon de commande).<br /> |ModeleEconomique=Payant<br /> |Relation=Biogenouest<br /> }}</div>

Aurélien Schmitt http://cat.opidor.fr/index.php?title=Plateforme_GENOMER&diff=47157 2025-08-28T09:04:37Z

<p>Aurélien Schmitt : </p> <hr /> <div>{{Infobox Service<br /> |Logo=Logo genomer.png<br /> |NomService=Plateforme GENOMER<br /> |TypeService=Plateforme d'acquisition<br /> |StatutService=En production<br /> |NomDéveloppé=Genomer - Plateforme de génomique<br /> |UrlService=www.sb-roscoff.fr/genomer<br /> |ContactMel=pf-genomer@sb-roscoff.fr<br /> |Localisation=Roscoff<br /> |StructureAppartenance=SBR, OSU STAMAR, EMBRC France<br /> |Tutelle=Sorbonne Université, CNRS<br /> |PhaseCycleVie=Collecte, Analyse<br /> |International=Non<br /> }}<br /> {{Coordonnées GPS<br /> |CoordonneeGeographique=48.72672, -3.98786<br /> }}<br /> {{Service<br /> |Description=Les missions de la '''Plateforme Genomer''' sont de :<br /> * mettre à disposition des équipements performants, conseiller et assurer la formation des utilisateurs : '''Mise A Disposition d’équipements-MAD'''<br /> <br /> * proposer un service d’accompagnement adapté pour la réalisation de projets de recherche : '''Conduite de Projet en Génomique-CPG'''.<br /> <br /> Elle fait partie intégrante de l’axe [[Biogenouest|Biogenouest]] Génomique. Ce réseau a pour but de mettre à disposition de la communauté scientifique, les outils nécessaires pour mener à bien des projets de séquençage et/ou de genotypage à petit, moyen, et haut débit, dans les domaines de la mer, de l’agronomie et de la santé.<br /> <br /> La plateforme Genomer (composante de Biogenouest Génomique) est labellisée IBiSA depuis avril 2012.<br /> <br /> La plateforme accueille des chercheurs dans le cadre de collaboration et de l’infrastructure nationale en Biologie et Santé : [[EMBRC France|EMBRC FR]].<br /> |Discipline=Vie &amp; Santé<br /> |SousDisciplineVie&amp;Sante=LS1 Molécules de la vie : Mécanismes biologiques, structures et fonctions; LS3 Biologie cellulaire, développement, cellules souches et régénération; LS8 Biologie environnementale, écologie et évolution<br /> |Thematique=Séquençage génomique, Génotypage<br /> |TypeDonnee=Données génomiques<br /> |Communaute=Laboratoires académiques<br /> |Beneficiaire=Communauté scientifique de Biogenouest<br /> |ConditionUsage=Il est demandé de renseigner une « Fiche Contact » qui sera analysé par l’équipe de la plateforme Genomer pour examiner la faisabilité du projet. Quand le projet est suffisamment abouti et clairement défini, une fiche d'engagement Conduite de Projet en Génomique (CPG) et un devis sont édités. Le projet débute dès réception des documents (fiche d'engagement signée et bon de commande).<br /> |ModeleEconomique=Payant<br /> |Relation=Biogenouest<br /> }}</div>

Aurélien Schmitt http://cat.opidor.fr/index.php?title=Plateforme_GENOMER&diff=47156 2025-08-28T08:04:36Z

<p>Aurélien Schmitt : </p> <hr /> <div>{{Infobox Service<br /> |Logo=Logo genomer.png<br /> |NomService=Plateforme GENOMER<br /> |TypeService=Plateforme d'acquisition<br /> |StatutService=En production<br /> |NomDéveloppé=Genomer - Plateforme de génomique<br /> |UrlService=www.sb-roscoff.fr/genomer<br /> |ContactMel=pf-genomer@sb-roscoff.fr<br /> |Localisation=Roscoff<br /> |StructureAppartenance=SBR, OSU STAMAR<br /> |Tutelle=Sorbonne Université, CNRS<br /> |PhaseCycleVie=Collecte, Analyse<br /> |International=Non<br /> }}<br /> {{Coordonnées GPS<br /> |CoordonneeGeographique=48.72672, -3.98786<br /> }}<br /> {{Service<br /> |Description=Les missions de la '''Plateforme Genomer''' sont de :<br /> * mettre à disposition des équipements performants, conseiller et assurer la formation des utilisateurs : '''Mise A Disposition d’équipements-MAD'''<br /> <br /> * proposer un service d’accompagnement adapté pour la réalisation de projets de recherche : '''Conduite de Projet en Génomique-CPG'''.<br /> <br /> Elle fait partie intégrante de l’axe [[Biogenouest|Biogenouest]] Génomique. Ce réseau a pour but de mettre à disposition de la communauté scientifique, les outils nécessaires pour mener à bien des projets de séquençage et/ou de genotypage à petit, moyen, et haut débit, dans les domaines de la mer, de l’agronomie et de la santé.<br /> <br /> La plateforme Genomer (composante de Biogenouest Génomique) est labellisée IBiSA depuis avril 2012.<br /> <br /> La plateforme accueille des chercheurs dans le cadre de collaboration et de l’infrastructure nationale en Biologie et Santé : [[EMBRC France|EMBRC FR]].<br /> |Discipline=Vie &amp; Santé<br /> |SousDisciplineVie&amp;Sante=LS1 Molécules de la vie : Mécanismes biologiques, structures et fonctions; LS3 Biologie cellulaire, développement, cellules souches et régénération; LS8 Biologie environnementale, écologie et évolution<br /> |Thematique=Séquençage génomique, Génotypage<br /> |TypeDonnee=Données génomiques<br /> |Communaute=Laboratoires académiques<br /> |Beneficiaire=Communauté scientifique de Biogenouest<br /> |ConditionUsage=Il est demandé de renseigner une « Fiche Contact » qui sera analysé par l’équipe de la plateforme Genomer pour examiner la faisabilité du projet. Quand le projet est suffisamment abouti et clairement défini, une fiche d'engagement Conduite de Projet en Génomique (CPG) et un devis sont édités. Le projet débute dès réception des documents (fiche d'engagement signée et bon de commande).<br /> |ModeleEconomique=Payant<br /> |Relation=Biogenouest<br /> }}</div>

Aurélien Schmitt http://cat.opidor.fr/index.php?title=Plateforme_GENOMER&diff=47119 2025-08-22T16:48:11Z

<p>Aurélien Schmitt : </p> <hr /> <div>{{Infobox Service<br /> |Logo=Logo genomer.png<br /> |NomService=Plateforme GENOMER<br /> |TypeService=Plateforme d'acquisition<br /> |StatutService=En production<br /> |NomDéveloppé=Genomer - Plateforme de génomique<br /> |UrlService=https://www.sb-roscoff.fr/fr/station-biologique-de-roscoff/services/plateformes-technologiques/genomer-plateforme-de-genomique<br /> |ContactMel=pf-genomer@sb-roscoff.fr<br /> |Localisation=Roscoff<br /> |StructureAppartenance=SBR<br /> |Tutelle=Sorbonne Université, CNRS<br /> |PhaseCycleVie=Collecte, Analyse<br /> |International=Non<br /> }}<br /> {{Coordonnées GPS<br /> |CoordonneeGeographique=48.72672, -3.98786<br /> }}<br /> {{Service<br /> |Description=Les missions de la Plateforme Genomer sont de :<br /> • mettre à disposition des équipements performants, conseiller et assurer la formation des utilisateurs : Mise A Disposition d’équipements-MAD<br /> <br /> • proposer un service d’accompagnement adapté pour la réalisation de vos projets de recherche : Conduite de Projet en Génomique-CPG<br /> <br /> Elle fait partie intégrante de l’axe Biogenouest Génomique. Ce réseau a pour but de mettre à disposition de la communauté scientifique, les outils nécessaires pour mener à bien des projets de séquençage et/ou de genotypage à petit, moyen, et haut débit, dans les domaines de la mer, de l’agronomie et de la santé.<br /> <br /> La plateforme Genomer (composante de Biogenouest Génomique) est labellisée IBISA depuis avril 2012.<br /> <br /> La plateforme accueille des chercheurs dans le cadre de collaboration et de l’infrastructure nationale en Biologie et Santé : EMBRC FR.<br /> |Discipline=Vie &amp; Santé<br /> |SousDisciplineVie&amp;Sante=LS1 Molécules de la vie : Mécanismes biologiques, structures et fonctions; LS3 Biologie cellulaire, développement, cellules souches et régénération; LS8 Biologie environnementale, écologie et évolution<br /> |Relation=Biogenouest<br /> }}</div>

Aurélien Schmitt http://cat.opidor.fr/index.php?title=Plateforme_OMICS&diff=47118 2025-08-22T16:46:53Z

<p>Aurélien Schmitt : Page créée avec « {{Infobox Service |NomService=Plateforme OMICS |TypeService=Plateforme d&#039;acquisition |StatutService=En production |NomDéveloppé=Plateforme OMICS |NomAlternatifRéduit=OMICS |UrlService=https://www.mio.osupytheas.fr/fr/recherche/structures-techniques/plateforme-omics/ |ContactMel=sonia.bouchard@mio.osupytheas.fr |Localisation=Marseille |StructureAppartenance=MIO, OSU Pythéas |Tutelle=Aix-Marseille Université |PhaseCycleVie=Collecte, Analyse |International=Non... »</p> <hr /> <div>{{Infobox Service<br /> |NomService=Plateforme OMICS<br /> |TypeService=Plateforme d'acquisition<br /> |StatutService=En production<br /> |NomDéveloppé=Plateforme OMICS<br /> |NomAlternatifRéduit=OMICS<br /> |UrlService=https://www.mio.osupytheas.fr/fr/recherche/structures-techniques/plateforme-omics/<br /> |ContactMel=sonia.bouchard@mio.osupytheas.fr<br /> |Localisation=Marseille<br /> |StructureAppartenance=MIO, OSU Pythéas<br /> |Tutelle=Aix-Marseille Université<br /> |PhaseCycleVie=Collecte, Analyse<br /> |International=Non<br /> }}<br /> {{Service<br /> |Description=OMICS est une plateforme qui engage son expertise analytique en Biologie Moléculaire et Bio-informatique pour la caractérisation taxonomique des procaryotes dans les écosystèmes marins.<br /> <br /> La partie Biologie Moléculaire d’OMICS propose à la communauté scientifique du MIO une mise à disposition d’appareils et de protocoles destinés à l’extraction, l’amplification et le contrôle d’acides nucléiques (ADN et/ou ARN) en vue d’un séquençage des communautés procaryotes basé sur le gène de l’ADN ribosomal 16S. Il est également envisageable que ces études soient entièrement prises en charge par le personnel de la plateforme que ce soit pour des projets des scientifiques du MIO ou d’autres organismes de recherche publics ou privés.<br /> <br /> La partie Bio-informatique d’OMICS propose à la communauté scientifique du MIO, du public et du privée, des analyses expertes en écologie numérique à travers la caractérisation de la biodiversité d’écosystèmes via le séquençage haut débit. Outre ces analyses expertes, des plans de formation en Bio-informatique sont régulièrement proposés et ouverts à la communauté scientifique.<br /> |Discipline=Vie &amp; Santé<br /> |SousDisciplineVie&amp;Sante=LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes; LS8 Biologie environnementale, écologie et évolution<br /> }}</div>

Aurélien Schmitt http://cat.opidor.fr/index.php?title=Plateforme_GENOMER&diff=47098 2025-08-20T14:19:46Z

<p>Aurélien Schmitt : </p> <hr /> <div>{{Infobox Service<br /> |Logo=Logo genomer.png<br /> |NomService=Plateforme GENOMER<br /> |TypeService=Plateforme d'acquisition<br /> |StatutService=En production<br /> |NomDéveloppé=Genomer - Plateforme de génomique<br /> |UrlService=https://www.sb-roscoff.fr/fr/station-biologique-de-roscoff/services/plateformes-technologiques/genomer-plateforme-de-genomique<br /> |ContactMel=pf-genomer@sb-roscoff.fr<br /> |Localisation=Roscoff<br /> |StructureAppartenance=SBR<br /> |Tutelle=Sorbonne Université, CNRS<br /> |PhaseCycleVie=Collecte<br /> |International=Non<br /> }}<br /> {{Coordonnées GPS<br /> |CoordonneeGeographique=48.72672, -3.98786<br /> }}<br /> {{Service<br /> |Description=Les missions de la Plateforme Genomer sont de :<br /> • mettre à disposition des équipements performants, conseiller et assurer la formation des utilisateurs : Mise A Disposition d’équipements-MAD<br /> <br /> • proposer un service d’accompagnement adapté pour la réalisation de vos projets de recherche : Conduite de Projet en Génomique-CPG<br /> <br /> Elle fait partie intégrante de l’axe Biogenouest Génomique. Ce réseau a pour but de mettre à disposition de la communauté scientifique, les outils nécessaires pour mener à bien des projets de séquençage et/ou de genotypage à petit, moyen, et haut débit, dans les domaines de la mer, de l’agronomie et de la santé.<br /> <br /> La plateforme Genomer (composante de Biogenouest Génomique) est labellisée IBISA depuis avril 2012.<br /> <br /> La plateforme accueille des chercheurs dans le cadre de collaboration et de l’infrastructure nationale en Biologie et Santé : EMBRC FR.<br /> |Discipline=Vie &amp; Santé<br /> |SousDisciplineVie&amp;Sante=LS1 Molécules de la vie : Mécanismes biologiques, structures et fonctions; LS3 Biologie cellulaire, développement, cellules souches et régénération; LS8 Biologie environnementale, écologie et évolution<br /> |Relation=Biogenouest<br /> }}</div>

Aurélien Schmitt http://cat.opidor.fr/index.php?title=Plateforme_GENOMER&diff=47097 2025-08-20T13:58:05Z

<p>Aurélien Schmitt : Page créée avec « {{Infobox Service |Logo=Logo genomer.png |NomService=Plateforme GENOMER |TypeService=Plateforme d&#039;acquisition |StatutService=En production |NomDéveloppé=Genomer - Plateforme de génomique |UrlService=https://www.sb-roscoff.fr/fr/station-biologique-de-roscoff/services/plateformes-technologiques/genomer-plateforme-de-genomique |ContactMel=pf-genomer@sb-roscoff.fr |Localisation=Roscoff |Tutelle=Sorbonne Université, CNRS |PhaseCycleVie=Collecte |International=Non... »</p> <hr /> <div>{{Infobox Service<br /> |Logo=Logo genomer.png<br /> |NomService=Plateforme GENOMER<br /> |TypeService=Plateforme d'acquisition<br /> |StatutService=En production<br /> |NomDéveloppé=Genomer - Plateforme de génomique<br /> |UrlService=https://www.sb-roscoff.fr/fr/station-biologique-de-roscoff/services/plateformes-technologiques/genomer-plateforme-de-genomique<br /> |ContactMel=pf-genomer@sb-roscoff.fr<br /> |Localisation=Roscoff<br /> |Tutelle=Sorbonne Université, CNRS<br /> |PhaseCycleVie=Collecte<br /> |International=Non<br /> }}<br /> {{Coordonnées GPS<br /> |CoordonneeGeographique=48.72672, -3.98786<br /> }}<br /> {{Service<br /> |Description=Les missions de la Plateforme Genomer sont de :<br /> • mettre à disposition des équipements performants, conseiller et assurer la formation des utilisateurs : Mise A Disposition d’équipements-MAD<br /> <br /> • proposer un service d’accompagnement adapté pour la réalisation de vos projets de recherche : Conduite de Projet en Génomique-CPG<br /> <br /> Elle fait partie intégrante de l’axe Biogenouest Génomique. Ce réseau a pour but de mettre à disposition de la communauté scientifique, les outils nécessaires pour mener à bien des projets de séquençage et/ou de genotypage à petit, moyen, et haut débit, dans les domaines de la mer, de l’agronomie et de la santé.<br /> <br /> La plateforme Genomer (composante de Biogenouest Génomique) est labellisée IBISA depuis avril 2012.<br /> <br /> La plateforme accueille des chercheurs dans le cadre de collaboration et de l’infrastructure nationale en Biologie et Santé : EMBRC FR.<br /> |Discipline=Vie &amp; Santé<br /> |SousDisciplineVie&amp;Sante=LS1 Molécules de la vie : Mécanismes biologiques, structures et fonctions; LS3 Biologie cellulaire, développement, cellules souches et régénération; LS8 Biologie environnementale, écologie et évolution<br /> |Relation=Biogenouest<br /> }}</div>

Aurélien Schmitt http://cat.opidor.fr/index.php?title=Fichier:Logo_genomer.png&diff=47096 2025-08-20T13:49:53Z

<p>Aurélien Schmitt : logo de genomer</p> <hr /> <div>logo de genomer</div>

Aurélien Schmitt http://cat.opidor.fr/index.php?title=GitLab_Station_Biologique_de_Roscoff&diff=46815 2025-07-01T11:53:22Z

<p>Aurélien Schmitt : Page créée avec « {{Infobox Service |NomService=GitLab Station Biologique de Roscoff |TypeService=Outils de gestion des codes |StatutService=En production |UrlService=https://gitlab.sb-roscoff.fr/ |ContactMel=mark.hoebeke@sb-roscoff.fr |Localisation=Roscoff |StructureAppartenance=SBR |Tutelle=Sorbonne Université, CNRS |PhaseCycleVie=Analyse, Documentation, Stockage, Conservation, Exposition, Réutilisation |International=Non }} {{Service |Description=Forge de la Station biologiqu... »</p> <hr /> <div>{{Infobox Service<br /> |NomService=GitLab Station Biologique de Roscoff<br /> |TypeService=Outils de gestion des codes<br /> |StatutService=En production<br /> |UrlService=https://gitlab.sb-roscoff.fr/<br /> |ContactMel=mark.hoebeke@sb-roscoff.fr<br /> |Localisation=Roscoff<br /> |StructureAppartenance=SBR<br /> |Tutelle=Sorbonne Université, CNRS<br /> |PhaseCycleVie=Analyse, Documentation, Stockage, Conservation, Exposition, Réutilisation<br /> |International=Non<br /> }}<br /> {{Service<br /> |Description=Forge de la Station biologique de Rsocoff<br /> |Discipline=Vie &amp; Santé<br /> |SousDisciplineVie&amp;Sante=LS2 Biologie intégrative : des gènes et des génomes aux systèmes; LS8 Biologie environnementale, écologie et évolution<br /> |TypeDonnee=Code source, Logiciel<br /> |TypeOutilsCodes=Forge logicielle<br /> |OuvertureProjet=Privé<br /> |ForgeSouveraine=Oui<br /> |StatutPage=Page en construction<br /> }}</div>

Aurélien Schmitt http://cat.opidor.fr/index.php?title=TETRA&diff=46813 2025-07-01T11:30:02Z

<p>Aurélien Schmitt : </p> <hr /> <div>{{Infobox Service<br /> |NomService=TETRA-EPOC Github<br /> |TypeService=Outils de gestion des codes<br /> |TypeEntrepot=Disciplinaire<br /> |TypeRestriction=Soumis à la création d'un compte<br /> |HebergementDonnees=France<br /> |StatutService=En production<br /> |NomDéveloppé=Techniques et Expertises TRAnsdisciplinaires du laboratoire EPOC UMR 5805<br /> |UrlService=https://github.com/TETRA-EPOC<br /> |ContactMel=vincent.hanquiez@u-bordeaux.fr,alicia.romero-ramirez@u-bordeaux.fr,yannick.geerebaert@u-bordeaux.fr<br /> |Localisation=Station Marine d'Arcachon<br /> Université de Bordeaux<br /> Place du Docteur Bertrand Peyneau<br /> 33120 ARCACHON CEDEX<br /> FRANCE<br /> |StructureAppartenance=Station Marine D'Arcachon<br /> |PhaseCycleVie=Analyse, Documentation, Stockage, Conservation, Exposition, Réutilisation<br /> |International=Non<br /> }}<br /> {{Service<br /> |Description=Le service TETRA (Techniques et Expertises TRAnsdisciplinaire) conduit des missions d'acquisition, de traitement et d'analyse de données, de développement logiciel, de conception et de mise en œuvre de dispositifs expérimentaux, de formation et d'assistance aux utilisateurs dans les domaines de l'information géographique, de l'imagerie scientifique et de l'électronique. Ce service interagit étroitement avec les équipes scientifiques, les plateformes et les services communs de l'Unité, ainsi que l'UMS 2567-POREA de l'OASU pour la maintenance du matériel, la transmission et le stockage de données.<br /> <br /> Missions<br /> <br /> <br /> * Acquisition de données marines et continentales.<br /> * Contrôle qualité, traitement et analyse de données océanographiques, topographiques, géophysiques et satellitaires.<br /> * Traitement d'images isolées et de séquences temporelles.<br /> * Optimisation et automatisation de chaînes de traitement.<br /> * Administration des SIG.<br /> * Edition cartographique.<br /> * Veille technologique et scientifique.<br /> * Contribution/Participation aux réseaux métiers locaux et nationaux.<br /> * Formation aux SIG, aux outils de traitement et d'analyse des données géographiques, à l'analyse d'images.<br /> * Assistance aux utilisateurs.<br /> |Discipline=Sciences &amp; Technologies<br /> |SousDisciplineVie&amp;Sante=LS8 Biologie environnementale, écologie et évolution<br /> |TypeDonnee=Code source, Logiciel<br /> |TypeOutilsCodes=Forge logicielle<br /> |OuvertureProjet=Public<br /> |HebergementDonnees=France<br /> |Communaute=Chercheurs, Ingénieurs de recherche, Enseignants-Chercheurs<br /> |Beneficiaire=Chercheur, enseignant-chercheur, ingéneur, doctorant, tout public<br /> }}</div>

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<p>Aurélien Schmitt : </p> <hr /> <div>{{Infobox Service<br /> |NomService=TETRA-EPOC Github<br /> |TypeService=Outils de gestion des codes<br /> |TypeEntrepot=Disciplinaire<br /> |TypeRestriction=Soumis à la création d'un compte<br /> |HebergementDonnees=France<br /> |StatutService=En production<br /> |NomDéveloppé=Techniques et Expertises TRAnsdisciplinaires du laboratoire EPOC UMR 5805<br /> |UrlService=https://github.com/TETRA-EPOC<br /> |ContactMel=vincent.hanquiez@u-bordeaux.fr,alicia.romero-ramirez@u-bordeaux.fr,yannick.geerebaert@u-bordeaux.fr<br /> |Localisation=Station Marine d'Arcachon<br /> Université de Bordeaux<br /> Place du Docteur Bertrand Peyneau<br /> 33120 ARCACHON CEDEX<br /> FRANCE<br /> |StructureAppartenance=Station Marine D'Arcachon<br /> |PhaseCycleVie=Analyse, Documentation, Stockage, Conservation, Exposition, Réutilisation<br /> |International=Non<br /> }}<br /> {{Service<br /> |Description=Le service TETRA (Techniques et Expertises TRAnsdisciplinaire) conduit des missions d'acquisition, de traitement et d'analyse de données, de développement logiciel, de conception et de mise en œuvre de dispositifs expérimentaux, de formation et d'assistance aux utilisateurs dans les domaines de l'information géographique, de l'imagerie scientifique et de l'électronique. Ce service interagit étroitement avec les équipes scientifiques, les plateformes et les services communs de l'Unité, ainsi que l'UMS 2567-POREA de l'OASU pour la maintenance du matériel, la transmission et le stockage de données.<br /> <br /> Missions<br /> <br /> <br /> * Acquisition de données marines et continentales.<br /> * Contrôle qualité, traitement et analyse de données océanographiques, topographiques, géophysiques et satellitaires.<br /> * Traitement d'images isolées et de séquences temporelles.<br /> * Optimisation et automatisation de chaînes de traitement.<br /> * Administration des SIG.<br /> * Edition cartographique.<br /> * Veille technologique et scientifique.<br /> * Contribution/Participation aux réseaux métiers locaux et nationaux.<br /> * Formation aux SIG, aux outils de traitement et d'analyse des données géographiques, à l'analyse d'images.<br /> * Assistance aux utilisateurs.<br /> |Discipline=Sciences &amp; Technologies<br /> |SousDisciplineVie&amp;Sante=LS8 Biologie environnementale, écologie et évolution<br /> |TypeOutilsCodes=Forge logicielle<br /> |OuvertureProjet=Public<br /> |HebergementDonnees=France<br /> |Communaute=Chercheurs, Ingénieurs de recherche, Enseignants-Chercheurs<br /> |Beneficiaire=Chercheur, enseignant-chercheur, ingéneur, doctorant, tout public<br /> |StatutPage=Page en construction<br /> }}</div>

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